261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1274 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
348 aa  692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  52.17 
 
 
354 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  49.39 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.19 
 
 
375 aa  299  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  49.19 
 
 
357 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  46.91 
 
 
355 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  53.54 
 
 
339 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  46.84 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  44.44 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  46.84 
 
 
355 aa  286  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  47.21 
 
 
366 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  45.29 
 
 
384 aa  271  9e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  46.39 
 
 
381 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
353 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  43.71 
 
 
360 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 
355 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  36.54 
 
 
340 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
365 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
335 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
335 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
355 aa  133  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  33.77 
 
 
335 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  34.21 
 
 
335 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
355 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  33.98 
 
 
340 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
357 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  32.48 
 
 
358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  34.17 
 
 
342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 
357 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  37.65 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  32.02 
 
 
339 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 
558 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.84 
 
 
1081 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.94 
 
 
648 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.62 
 
 
744 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30.48 
 
 
643 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.49 
 
 
701 aa  69.7  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 
575 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.1 
 
 
637 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.84 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
632 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  35.26 
 
 
1080 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.61 
 
 
575 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
574 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  28.37 
 
 
577 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  29.85 
 
 
651 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.63 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 
589 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.42 
 
 
701 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  30.12 
 
 
724 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 
712 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  31.17 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  28.87 
 
 
449 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.69 
 
 
1089 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 
702 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.44 
 
 
650 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
641 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  31.52 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
592 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 
578 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.6 
 
 
858 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
437 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 
699 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 
572 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  27.84 
 
 
488 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  34.75 
 
 
514 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  23.94 
 
 
561 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.21 
 
 
758 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  29.89 
 
 
488 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 
464 aa  60.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.75 
 
 
672 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.17 
 
 
632 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.47 
 
 
656 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  29.41 
 
 
571 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
564 aa  60.1  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.17 
 
 
465 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  29.21 
 
 
593 aa  59.7  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.15 
 
 
440 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
645 aa  59.7  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.47 
 
 
737 aa  59.3  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 
859 aa  59.3  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  30.21 
 
 
592 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.43 
 
 
643 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
439 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
572 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 
756 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 
468 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 
641 aa  55.8  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  23.3 
 
 
348 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 
421 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>