More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3943 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 592 aa  1193    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3704  ferredoxin  85.3 
 
 		 592 aa  963    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  62.94 
 
 		 577 aa  720    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  74.53 
 
 		 589 aa  867    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  49.81 
 
 		 574 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  47.13 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  47.48 
 
 		 575 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  47.61 
 
 		 575 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  39.43 
 
 		 564 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  37.11 
 
 		 571 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  37.39 
 
 		 572 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0348  ferredoxin  38.52 
 
 		 589 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0433038 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  36.4 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5960  adenylate/guanylate cyclase  38.28 
 
 		 572 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0259614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 		 580 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  37.64 
 
 		 553 aa  303  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  36.4 
 
 		 561 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4418  adenylate/guanylate cyclase  38.79 
 
 		 547 aa  299  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 578 aa  266  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  33.98 
 
 		 586 aa  264  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1968  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 555 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.76 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.83 
 
 		 645 aa  110  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.77 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.13 
 
 		 723 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.65 
 
 		 723 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  40.22 
 
 		 439 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 		 675 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.66 
 
 		 725 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  33.87 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 		 483 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 483 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 		 735 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 		 759 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 		 681 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  35.63 
 
 		 410 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.09 
 
 		 701 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  35.87 
 
 		 421 aa  97.4  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  36.76 
 
 		 549 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  30.92 
 
 		 760 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 794 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  36.16 
 
 		 407 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 699 aa  96.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 		 528 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 		 528 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 		 528 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.83 
 
 		 500 aa  95.5  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.4 
 
 		 764 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 		 756 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.37 
 
 		 657 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  28.72 
 
 		 797 aa  94.4  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.88 
 
 		 656 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 		 858 aa  94.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  35.64 
 
 		 469 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 		 740 aa  94  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  38.22 
 
 		 431 aa  94  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.38 
 
 		 524 aa  93.6  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.72 
 
 		 638 aa  93.6  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  30.81 
 
 		 636 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.32 
 
 		 585 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  35.87 
 
 		 514 aa  93.6  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 607 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  40.13 
 
 		 428 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 		 488 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.3 
 
 		 757 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  36.51 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  39.78 
 
 		 468 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 		 903 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  38.51 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  38.06 
 
 		 488 aa  92  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4494  hypothetical protein  32.63 
 
 		 293 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  29.63 
 
 		 358 aa  91.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 		 731 aa  91.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.68 
 
 		 577 aa  91.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  28.72 
 
 		 670 aa  91.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 861 aa  91.3  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 		 744 aa  91.3  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.67 
 
 		 672 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  26.96 
 
 		 701 aa  90.9  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  27.92 
 
 		 859 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 864 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.88 
 
 		 584 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 		 367 aa  90.5  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 		 370 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.12 
 
 		 696 aa  90.1  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  36.56 
 
 		 536 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.67 
 
 		 656 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  36.51 
 
 		 532 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  34.26 
 
 		 459 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 1172 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 734 aa  89.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.44 
 
 		 658 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.96 
 
 		 701 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.48 
 
 		 648 aa  88.6  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.79 
 
 		 584 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 		 860 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.64 
 
 		 753 aa  87.8  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  32.62 
 
 		 650 aa  87.8  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>