106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2947 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
340 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  81.74 
 
 
335 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  81.74 
 
 
355 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  81.85 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  81.44 
 
 
335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  81.44 
 
 
335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  81.74 
 
 
355 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  81.44 
 
 
355 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  81.55 
 
 
357 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  81.74 
 
 
355 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  82.58 
 
 
355 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  81.74 
 
 
355 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  81.44 
 
 
335 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  78.76 
 
 
339 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  80.36 
 
 
358 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  73.87 
 
 
342 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 
366 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 
357 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  32.36 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.36 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  32.36 
 
 
355 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.93 
 
 
375 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
339 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  31.16 
 
 
353 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
353 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 
354 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
384 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 
360 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  33.05 
 
 
353 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
381 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 
365 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
366 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  30.54 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 
363 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  27.75 
 
 
340 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.04 
 
 
618 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.52 
 
 
618 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.55 
 
 
753 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  23.32 
 
 
756 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3830  adenylate/guanylate cyclase  26.73 
 
 
486 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3904  putative adenylate/guanylate cyclase  26.73 
 
 
486 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0256204  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3816  putative adenylate/guanylate cyclase  26.73 
 
 
486 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.77 
 
 
759 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  25.91 
 
 
760 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.11 
 
 
694 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  21.94 
 
 
513 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.13 
 
 
656 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  23.16 
 
 
752 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.41 
 
 
764 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  23.33 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 
367 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 
701 aa  53.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  24.05 
 
 
645 aa  52  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  23.94 
 
 
370 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  22.22 
 
 
681 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  24.35 
 
 
1037 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.13 
 
 
657 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  24.43 
 
 
570 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  23.11 
 
 
401 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  24.68 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  21.62 
 
 
699 aa  50.4  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.54 
 
 
500 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  21.23 
 
 
741 aa  50.1  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.72 
 
 
1093 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 
1156 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  24.6 
 
 
348 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  21.07 
 
 
738 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  23.73 
 
 
488 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  22.4 
 
 
725 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  23.33 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 
729 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  22.95 
 
 
1020 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  22.7 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  24.38 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  21.67 
 
 
1119 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4184  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.67 
 
 
524 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  23.44 
 
 
1105 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  22.51 
 
 
1134 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.49 
 
 
744 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  21.93 
 
 
517 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  23.08 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  22.16 
 
 
381 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  21.98 
 
 
553 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.77 
 
 
611 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1160 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  23.03 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  22.1 
 
 
675 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  20.53 
 
 
723 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  24.18 
 
 
488 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  19.4 
 
 
672 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.98 
 
 
622 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  25.36 
 
 
1046 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  24 
 
 
308 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  23.6 
 
 
532 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  20.88 
 
 
701 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  22.75 
 
 
518 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  18.75 
 
 
656 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  19.13 
 
 
696 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>