236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1386 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 366 aa  718    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  78.92 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  74.93 
 
 		 355 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  73.65 
 
 		 355 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  74.93 
 
 		 355 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  62.21 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  64.14 
 
 		 381 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  52.54 
 
 		 384 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  46.61 
 
 		 353 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  45.72 
 
 		 353 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  49.85 
 
 		 353 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  51.28 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  49.23 
 
 		 375 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  46.31 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  47.21 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  52.04 
 
 		 339 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  38.46 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  35.78 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  34.05 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  34.48 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  34.05 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  34.05 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  33.74 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  34.05 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  34.05 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  34.05 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  32.21 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 		 357 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  29.18 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.63 
 
 		 672 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.36 
 
 		 656 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.7 
 
 		 744 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.06 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  30.05 
 
 		 636 aa  69.7  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.87 
 
 		 737 aa  69.7  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  25.68 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 		 645 aa  68.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.37 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.43 
 
 		 665 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.62 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 		 651 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 		 701 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.97 
 
 		 701 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.72 
 
 		 648 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.43 
 
 		 1089 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.63 
 
 		 701 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.32 
 
 		 753 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.62 
 
 		 678 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.71 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.22 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  24.48 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  30.61 
 
 		 726 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 		 643 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 		 364 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  23.92 
 
 		 758 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  27.1 
 
 		 759 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.07 
 
 		 725 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.19 
 
 		 618 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 		 734 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.22 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  26.27 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 		 699 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.38 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  23.74 
 
 		 758 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  22.6 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  27.63 
 
 		 724 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  25.32 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.7 
 
 		 637 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.19 
 
 		 632 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.75 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  22.22 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  24.68 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.41 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  25 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 861 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.86 
 
 		 757 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  27.78 
 
 		 513 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  24.26 
 
 		 479 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 		 572 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  25.82 
 
 		 760 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 		 713 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  25.63 
 
 		 589 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 702 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  30.52 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>