More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0722 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  72.85 
 
 
622 aa  786    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 
613 aa  1134    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  49.68 
 
 
628 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  43.8 
 
 
618 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  44.11 
 
 
618 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 
746 aa  187  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  26.85 
 
 
614 aa  173  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.4 
 
 
658 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.41 
 
 
696 aa  171  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  24.42 
 
 
794 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  29.44 
 
 
670 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.26 
 
 
611 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.38 
 
 
656 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.58 
 
 
672 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 
665 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.15 
 
 
575 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  20.03 
 
 
641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  28.53 
 
 
729 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.06 
 
 
737 aa  130  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  28.84 
 
 
645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  23.4 
 
 
735 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.12 
 
 
758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.63 
 
 
638 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  24.32 
 
 
607 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  21.24 
 
 
643 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  26.98 
 
 
701 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.88 
 
 
757 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.16 
 
 
643 aa  124  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  25.48 
 
 
744 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.12 
 
 
754 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.84 
 
 
758 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  22.92 
 
 
758 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  24.21 
 
 
744 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  24.17 
 
 
741 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.73 
 
 
597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  42.08 
 
 
468 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  21.42 
 
 
738 aa  117  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.53 
 
 
657 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  44.74 
 
 
428 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.94 
 
 
723 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.46 
 
 
723 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.53 
 
 
678 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  26.92 
 
 
752 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.53 
 
 
632 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  24.01 
 
 
721 aa  113  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 
734 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  24.9 
 
 
582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.15 
 
 
656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 
759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  27.77 
 
 
725 aa  112  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 
696 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  26.4 
 
 
731 aa  110  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  28.03 
 
 
729 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  37.55 
 
 
469 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  26.63 
 
 
760 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.11 
 
 
764 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  24.79 
 
 
758 aa  108  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.16 
 
 
753 aa  107  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.56 
 
 
652 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  22.98 
 
 
694 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.96 
 
 
784 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
777 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  34.87 
 
 
459 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.27 
 
 
825 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  24.79 
 
 
667 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
757 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  28.66 
 
 
654 aa  100  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 
641 aa  99.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.1 
 
 
645 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  26.91 
 
 
284 aa  98.6  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  28.57 
 
 
513 aa  97.8  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
464 aa  97.4  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  33.82 
 
 
437 aa  97.4  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  32.63 
 
 
799 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
777 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.24 
 
 
483 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.24 
 
 
483 aa  95.9  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
819 aa  95.1  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  26.8 
 
 
635 aa  94.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.77 
 
 
650 aa  94  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.58 
 
 
701 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
632 aa  93.6  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  28.18 
 
 
699 aa  93.6  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.47 
 
 
761 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
558 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  37.36 
 
 
577 aa  91.3  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.05 
 
 
935 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  35.12 
 
 
766 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1407  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 
691 aa  90.5  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  34.55 
 
 
449 aa  90.1  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  33.33 
 
 
751 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  33.33 
 
 
795 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
795 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
795 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
795 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  30.66 
 
 
487 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  26.22 
 
 
902 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
828 aa  88.6  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
795 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 
903 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>