More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4597 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  73.59 
 
 		 613 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  100 
 
 		 622 aa  1189    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0326  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  48.63 
 
 		 628 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  44.67 
 
 		 618 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  45 
 
 		 618 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 		 746 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.04 
 
 		 696 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.15 
 
 		 658 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.72 
 
 		 614 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  29.09 
 
 		 670 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.52 
 
 		 611 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  24.44 
 
 		 794 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  20.49 
 
 		 641 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  28.1 
 
 		 729 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.5 
 
 		 758 aa  133  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 		 729 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.21 
 
 		 597 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 		 758 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  24.17 
 
 		 734 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  30.31 
 
 		 632 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  21.43 
 
 		 643 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.8 
 
 		 638 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.24 
 
 		 737 aa  127  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  23.81 
 
 		 758 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  27 
 
 		 645 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 		 741 aa  124  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 		 701 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.28 
 
 		 665 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.44 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.09 
 
 		 754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 607 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  27.21 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.21 
 
 		 656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  26.17 
 
 		 758 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 		 744 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  35.93 
 
 		 469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.93 
 
 		 701 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 468 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.99 
 
 		 632 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.04 
 
 		 652 aa  111  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  25.36 
 
 		 645 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  22.87 
 
 		 738 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.54 
 
 		 657 aa  111  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6815  adenylate/guanylate cyclase  39.37 
 
 		 428 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.741432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  23.3 
 
 		 582 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  25.86 
 
 		 760 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  24.72 
 
 		 721 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.22 
 
 		 643 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  23.42 
 
 		 694 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.58 
 
 		 656 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  22.55 
 
 		 735 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.53 
 
 		 678 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  25.2 
 
 		 759 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.31 
 
 		 672 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.69 
 
 		 757 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  27.72 
 
 		 635 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.88 
 
 		 825 aa  104  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 757 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  34.87 
 
 		 437 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  25.98 
 
 		 752 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 777 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.07 
 
 		 761 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  24.79 
 
 		 731 aa  99.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  23.2 
 
 		 696 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  23.58 
 
 		 744 aa  97.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  29.86 
 
 		 464 aa  97.4  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  35.68 
 
 		 459 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 819 aa  97.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.47 
 
 		 500 aa  96.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 795 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 		 699 aa  96.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 777 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 795 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 795 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 795 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  24.13 
 
 		 667 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  34.36 
 
 		 795 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  25.68 
 
 		 725 aa  94.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 654 aa  94.4  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.4 
 
 		 753 aa  93.6  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  29.06 
 
 		 483 aa  93.2  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.33 
 
 		 701 aa  93.2  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.16 
 
 		 784 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  29.06 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  28.06 
 
 		 650 aa  92.8  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.59 
 
 		 723 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  33 
 
 		 558 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 828 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.88 
 
 		 723 aa  92  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  28.97 
 
 		 513 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  29.12 
 
 		 449 aa  91.3  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 		 589 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 795 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.23 
 
 		 701 aa  90.5  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.35 
 
 		 703 aa  90.9  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 		 574 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  26.68 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  36.87 
 
 		 571 aa  90.1  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  35.14 
 
 		 577 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 		 364 aa  90.1  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>