More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0057 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 		 650 aa  1291    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  59.62 
 
 		 656 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  60.03 
 
 		 657 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.3 
 
 		 754 aa  326  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 		 744 aa  308  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.2 
 
 		 701 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 756 aa  251  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  32.82 
 
 		 760 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.38 
 
 		 696 aa  248  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.73 
 
 		 614 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.38 
 
 		 764 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.86 
 
 		 753 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  38.06 
 
 		 752 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  44.25 
 
 		 729 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 759 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 		 746 aa  230  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  34.98 
 
 		 670 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  28.46 
 
 		 794 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  47.48 
 
 		 734 aa  216  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.55 
 
 		 723 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.88 
 
 		 758 aa  213  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  32.28 
 
 		 725 aa  211  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  39.88 
 
 		 694 aa  209  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  30.47 
 
 		 638 aa  209  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 		 696 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.78 
 
 		 703 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  45.2 
 
 		 741 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.37 
 
 		 658 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 		 607 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.94 
 
 		 758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  27.96 
 
 		 667 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.16 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.65 
 
 		 936 aa  192  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  42.86 
 
 		 737 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 		 641 aa  190  8e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 731 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  29.96 
 
 		 582 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  39.64 
 
 		 717 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.56 
 
 		 632 aa  187  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  29.26 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  32.58 
 
 		 758 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.17 
 
 		 701 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  35.5 
 
 		 758 aa  183  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  37.29 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.98 
 
 		 672 aa  178  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  37.59 
 
 		 702 aa  178  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.6 
 
 		 864 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  37.29 
 
 		 701 aa  177  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.34 
 
 		 611 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 		 641 aa  172  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.6 
 
 		 656 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 721 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  36.61 
 
 		 859 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.83 
 
 		 597 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 		 738 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.82 
 
 		 650 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 		 729 aa  164  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  26.91 
 
 		 744 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.29 
 
 		 858 aa  161  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.21 
 
 		 861 aa  161  4e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  37.39 
 
 		 483 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  36.97 
 
 		 483 aa  160  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 		 665 aa  160  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40.99 
 
 		 903 aa  160  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 		 675 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 712 aa  157  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.91 
 
 		 860 aa  156  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  35.86 
 
 		 911 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.42 
 
 		 761 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 		 681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.68 
 
 		 757 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  26.21 
 
 		 699 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  41.1 
 
 		 724 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 		 593 aa  147  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  25.54 
 
 		 735 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  31.86 
 
 		 636 aa  147  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  33.82 
 
 		 726 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  36.48 
 
 		 713 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  36.86 
 
 		 1119 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  32.7 
 
 		 753 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  37.44 
 
 		 536 aa  140  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.27 
 
 		 652 aa  140  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37 
 
 		 577 aa  138  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  38.24 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.26 
 
 		 643 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  33.67 
 
 		 446 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.62 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  30.74 
 
 		 479 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 1805 aa  131  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  33.33 
 
 		 463 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  35.37 
 
 		 441 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  35.22 
 
 		 740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  30.98 
 
 		 284 aa  128  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  34.06 
 
 		 431 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.75 
 
 		 797 aa  126  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  43.01 
 
 		 585 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  36.61 
 
 		 1207 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  26.92 
 
 		 645 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>