263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3172 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
357 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  79.2 
 
 
366 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  77.68 
 
 
355 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  76.69 
 
 
355 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  78.99 
 
 
355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  63.82 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  63.2 
 
 
381 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  53.5 
 
 
384 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  48.48 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  47.42 
 
 
353 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  50.44 
 
 
375 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  51.69 
 
 
354 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  51.25 
 
 
353 aa  305  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  49.53 
 
 
360 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  54.79 
 
 
339 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  48.31 
 
 
348 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  34.16 
 
 
342 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
365 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 
340 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  30.99 
 
 
357 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
361 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
355 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  33.23 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  31.69 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  30.99 
 
 
335 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
355 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  32.05 
 
 
358 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 
363 aa  136  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  28.52 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  28.33 
 
 
577 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.01 
 
 
672 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.38 
 
 
656 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.95 
 
 
744 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  28.57 
 
 
636 aa  73.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 
464 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30 
 
 
658 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.29 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 
645 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.07 
 
 
737 aa  70.1  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  25.31 
 
 
701 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.39 
 
 
613 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.93 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
643 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.78 
 
 
753 aa  66.2  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  34.27 
 
 
411 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  28.4 
 
 
759 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
411 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.1 
 
 
648 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.43 
 
 
665 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  26.67 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.05 
 
 
1089 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.87 
 
 
637 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.41 
 
 
701 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
651 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
724 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.09 
 
 
701 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.51 
 
 
764 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  26.92 
 
 
760 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.38 
 
 
618 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.03 
 
 
638 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.49 
 
 
650 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
618 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  25.79 
 
 
483 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 
729 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  27.14 
 
 
589 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 
699 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 
726 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  25.56 
 
 
479 aa  60.5  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  25.16 
 
 
483 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  25.67 
 
 
758 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
468 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  30.04 
 
 
431 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
439 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 
575 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.8 
 
 
575 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 
741 aa  59.7  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  24.59 
 
 
756 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 
662 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 
575 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  22.91 
 
 
348 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  26.18 
 
 
860 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.23 
 
 
662 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.18 
 
 
500 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  29.19 
 
 
641 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  22.75 
 
 
641 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  28.76 
 
 
725 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.16 
 
 
678 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
632 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  24.46 
 
 
632 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>