140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2634 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  52.74 
 
 
216 aa  198  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  40.72 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  39.42 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  37.98 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  37.88 
 
 
273 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5688  putative adenylate/guanylate cyclase  41.46 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.427461 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5323  putative adenylate/guanylate cyclase  41.46 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.680293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  47.62 
 
 
373 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  36.79 
 
 
425 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  38.92 
 
 
397 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 
411 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  44.95 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  40.34 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  37.35 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  37.35 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  36.75 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  35.54 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3687  putative adenylate/guanylate cyclase  46.77 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
348 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  34.9 
 
 
435 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2885  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.77 
 
 
588 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.448647  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2813  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 
648 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  34.71 
 
 
424 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.68 
 
 
371 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  34.71 
 
 
374 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  30.15 
 
 
400 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  31.18 
 
 
652 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0527  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
647 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0681662  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
295 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
597 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
664 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 
306 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 
647 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  31.28 
 
 
642 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.61 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 
667 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
364 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  32.56 
 
 
310 aa  55.5  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.18 
 
 
634 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
308 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.15 
 
 
289 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  34.71 
 
 
334 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  29.03 
 
 
378 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.22 
 
 
595 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.72 
 
 
723 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 
345 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 
315 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
471 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
348 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  30.77 
 
 
346 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.37 
 
 
598 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 
337 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
337 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3142  adenylate/guanylate cyclase  34.67 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000152913  normal  0.51761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0096  adenylate/guanylate cyclase  31.16 
 
 
647 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.019026  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.77 
 
 
643 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  34.15 
 
 
330 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  35.94 
 
 
404 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  33.33 
 
 
553 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.74 
 
 
738 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4701  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
658 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.946311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  37.4 
 
 
350 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
279 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
279 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2975  adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
333 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.931348  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3473  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.12 
 
 
596 aa  48.9  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3019  putative adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
333 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 
373 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
315 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
301 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  25.56 
 
 
1156 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  34.4 
 
 
294 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
355 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  30.91 
 
 
395 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
357 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.13 
 
 
568 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  26.47 
 
 
304 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  26.71 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  31.65 
 
 
313 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 
357 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
422 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2817  putative adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 
150 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1000  heavy metal translocating P-type ATPase  47.22 
 
 
809 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111426 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 
350 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  24.31 
 
 
348 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4613  putative adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.863604  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 
279 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1836  heavy metal translocating P-type ATPase  48.57 
 
 
794 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
472 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  32 
 
 
362 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.98 
 
 
622 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1384  putative adenylate cyclase  28.16 
 
 
581 aa  45.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316041  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  31.91 
 
 
531 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
861 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0131  copper-translocating P-type ATPase  54.05 
 
 
786 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0671969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>