More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2803 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2803  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 531 aa  1068    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  42.75 
 
 		 520 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 		 351 aa  358  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  46.55 
 
 		 355 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  38.82 
 
 		 395 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2092  adenylate/guanylate cyclase  39.28 
 
 		 395 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.498255  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 		 381 aa  233  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1528  adenylate/guanylate cyclase  40.06 
 
 		 350 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  48.37 
 
 		 1209 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0215  adenylate/guanylate cyclase  39 
 
 		 351 aa  211  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  43.33 
 
 		 1207 aa  199  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1562  adenylate/guanylate cyclase  46.48 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.165048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  45.67 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 406 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2382  adenylate/guanylate cyclase  42.92 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3414  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  44.65 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  34.77 
 
 		 411 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  46.15 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  43 
 
 		 443 aa  171  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  39.27 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3041  adenylate cyclase  41.06 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14332  normal  0.182676 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3084  adenylate cyclase  40.58 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3025  adenylate/guanylate cyclase  40.58 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  41.38 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.69 
 
 		 1207 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2839  putative adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  50.74 
 
 		 385 aa  140  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  41.58 
 
 		 1169 aa  136  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  40.31 
 
 		 1128 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  35.79 
 
 		 816 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  38.22 
 
 		 868 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3136  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50.38 
 
 		 919 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 1172 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  32.54 
 
 		 1075 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  33.23 
 
 		 380 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38 
 
 		 900 aa  123  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  35.79 
 
 		 1196 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  36.36 
 
 		 1198 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  37.37 
 
 		 806 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  36.65 
 
 		 1773 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  35.29 
 
 		 1987 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43826  predicted protein  37.7 
 
 		 1003 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911661  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  37.89 
 
 		 1165 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  31.89 
 
 		 1156 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  26.16 
 
 		 1130 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  26.04 
 
 		 1133 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2343  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50.38 
 
 		 921 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.762005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  27.95 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 1180 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12462  cyclase  31.82 
 
 		 730 aa  114  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  28.01 
 
 		 1119 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0225  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.04 
 
 		 695 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590775  normal  0.132241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  47.24 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  29.43 
 
 		 382 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  46.46 
 
 		 457 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  31.12 
 
 		 421 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_4823  predicted protein  37.24 
 
 		 145 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.121915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 665 aa  101  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  46.34 
 
 		 455 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  43.61 
 
 		 454 aa  100  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  43.2 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1547  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.33 
 
 		 758 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.592629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 372 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  39.04 
 
 		 701 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.22 
 
 		 469 aa  97.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  42.4 
 
 		 457 aa  97.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.71 
 
 		 353 aa  97.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  34.59 
 
 		 151 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  41.6 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 374 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 461 aa  96.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  43.2 
 
 		 457 aa  95.9  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  43.85 
 
 		 244 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  33.04 
 
 		 705 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  41.6 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  44.26 
 
 		 705 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  43.55 
 
 		 414 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1438  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 		 393 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.92182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  43.09 
 
 		 457 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 564 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3878  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.08 
 
 		 892 aa  94.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  35.2 
 
 		 462 aa  94.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  42.37 
 
 		 460 aa  94  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 233 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 233 aa  94  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2397  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.68 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.593336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.09 
 
 		 454 aa  94  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 234 aa  93.6  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.12 
 
 		 322 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 217 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 		 328 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.84 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.09 
 
 		 711 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  40 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>