20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2661 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  32.37 
 
 		 504 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  31.11 
 
 		 537 aa  92.8  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  30.53 
 
 		 534 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0984  hypothetical protein  27.75 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  26.01 
 
 		 661 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  29.38 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3126  hypothetical protein  31.58 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000917483  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  26.09 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  23.73 
 
 		 496 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  23.95 
 
 		 1611 aa  49.7  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1238 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5261  hypothetical protein  27.67 
 
 		 690 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165104  hitchhiker  0.00234042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  35.65 
 
 		 848 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2010  hypothetical protein  23.15 
 
 		 528 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501978 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1596 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 1714 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2348  hypothetical protein  24.6 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389344  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.73 
 
 		 1914 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0620  hypothetical protein  31.53 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>