69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0620 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592031 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2329  hypothetical protein  66.67 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.419941 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 671 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1596 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  36.51 
 
 		 1611 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 1064 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 953 aa  56.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 652 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  33.81 
 
 		 996 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 802 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  31.21 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  35.65 
 
 		 489 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1298 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1285 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  35.82 
 
 		 910 aa  52.8  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  37.9 
 
 		 1044 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  34.84 
 
 		 910 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 		 989 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 640 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 938 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  38.89 
 
 		 994 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 736 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  37.68 
 
 		 776 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 966 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.97 
 
 		 943 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1238 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 1450 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 776 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 1105 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 924 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.51 
 
 		 827 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  34.78 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  34.23 
 
 		 793 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  32.54 
 
 		 916 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 775 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1319  hypothetical protein  32.14 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  35.25 
 
 		 828 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.03 
 
 		 840 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  35.86 
 
 		 886 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  33.59 
 
 		 960 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 973 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 1066 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.51 
 
 		 964 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 601 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 1034 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 		 1424 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  34.38 
 
 		 792 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  29.07 
 
 		 957 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2159  hypothetical protein  32.54 
 
 		 433 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  35.15 
 
 		 806 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  33.9 
 
 		 1055 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.37 
 
 		 999 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  45.28 
 
 		 818 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 393 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  31.52 
 
 		 921 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  29.31 
 
 		 856 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  33.53 
 
 		 1001 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  37.5 
 
 		 1004 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  37.59 
 
 		 926 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 952 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5578  hypothetical protein  27.93 
 
 		 502 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  32.09 
 
 		 1145 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  32.12 
 
 		 854 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  29.92 
 
 		 534 aa  43.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 877 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 872 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 950 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 1714 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>