177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2159 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2159  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  874    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  38.4 
 
 		 856 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 798 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 736 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3848  NB-ARC domain-containing protein  31.09 
 
 		 811 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.45 
 
 		 1102 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  30.64 
 
 		 1058 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.43 
 
 		 999 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  30.04 
 
 		 776 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  29.3 
 
 		 1087 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  33.65 
 
 		 760 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 779 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  31.17 
 
 		 1050 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  30.77 
 
 		 1092 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 877 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  32.37 
 
 		 1119 aa  89.7  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 1042 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 618 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 901 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  32.34 
 
 		 1056 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  29.62 
 
 		 1017 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 1043 aa  87  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 812 aa  86.3  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  28.67 
 
 		 982 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  32.26 
 
 		 792 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  30.74 
 
 		 1110 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 726 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 1227 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 973 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  27.35 
 
 		 973 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  30.64 
 
 		 1014 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  29.3 
 
 		 824 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 888 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  29.24 
 
 		 827 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  29.63 
 
 		 1103 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 765 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  30.14 
 
 		 840 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 973 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  28.79 
 
 		 797 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  30.8 
 
 		 959 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  27.48 
 
 		 1049 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 948 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 966 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  27.38 
 
 		 907 aa  80.1  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.87 
 
 		 1104 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  31.39 
 
 		 1093 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  29.03 
 
 		 916 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2157  hypothetical protein  28.15 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 928 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 775 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 1066 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  27.72 
 
 		 1097 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  32.35 
 
 		 960 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 886 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 948 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 931 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 972 aa  76.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  30.49 
 
 		 818 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  31.31 
 
 		 755 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 630 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 729 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 804 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 953 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  31.78 
 
 		 780 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 1082 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 768 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 952 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 954 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  29.07 
 
 		 961 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.22 
 
 		 701 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  24.63 
 
 		 816 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 1064 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  27.62 
 
 		 1125 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 943 aa  73.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 831 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  28.96 
 
 		 630 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  29.37 
 
 		 1036 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  28.3 
 
 		 1085 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 799 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  29.52 
 
 		 1100 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  30.03 
 
 		 951 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 1137 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  26.73 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  28.4 
 
 		 996 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 1001 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  28.33 
 
 		 1058 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  34.23 
 
 		 1044 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  27.22 
 
 		 777 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  32.98 
 
 		 1186 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  27.47 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 950 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 802 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  26.67 
 
 		 1010 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  28.83 
 
 		 1072 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.32 
 
 		 1055 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>