44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4219 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  100 
 
 
806 aa  1655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  40.57 
 
 
823 aa  538  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  38.45 
 
 
835 aa  532  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4218  heterocyst differentiation protein  41.43 
 
 
303 aa  204  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2711  FHA domain-containing protein  30.47 
 
 
544 aa  150  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  31.11 
 
 
569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0305  FHA domain-containing protein  28.54 
 
 
525 aa  146  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  31.44 
 
 
559 aa  139  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  30.26 
 
 
562 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  30.26 
 
 
562 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.87 
 
 
943 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  25.08 
 
 
689 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  29.29 
 
 
1238 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  24.78 
 
 
697 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  21.71 
 
 
496 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  23.12 
 
 
1689 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2131  Extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 
813 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.651568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  24.5 
 
 
699 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
1958 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  26.73 
 
 
489 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  27.42 
 
 
1914 aa  75.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  26.47 
 
 
1611 aa  75.1  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  22.67 
 
 
467 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
1714 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  25.47 
 
 
1203 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5312  Appr-1-p processing domain protein  26.62 
 
 
694 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 
1313 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0053  hypothetical protein  26.34 
 
 
750 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0689055  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  24.33 
 
 
1073 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  25.09 
 
 
440 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  22.56 
 
 
534 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  19.75 
 
 
1298 aa  55.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1258  polysaccharide deacetylase  24.17 
 
 
699 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252566  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
1285 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 
928 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  23.77 
 
 
782 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  22.26 
 
 
1063 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  18.63 
 
 
1279 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
1526 aa  48.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2076  protein of unknown function DUF900, hydrolase-like  26.7 
 
 
661 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.445606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.51 
 
 
1195 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 
1596 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5318  hypothetical protein  23.53 
 
 
550 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120389  normal  0.353542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  23.16 
 
 
504 aa  44.3  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>