33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3192 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  100 
 
 		 933 aa  1833    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  43.64 
 
 		 1831 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  32.74 
 
 		 2159 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1805 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1878 aa  283  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1921 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1460 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1937 aa  201  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1025 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.78 
 
 		 532 aa  63.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  25 
 
 		 1268 aa  57.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  24.93 
 
 		 659 aa  57  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 916 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1162 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 		 1162 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.24 
 
 		 919 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1147 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  20.67 
 
 		 868 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.81 
 
 		 1007 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  29.93 
 
 		 848 aa  48.9  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.76 
 
 		 1328 aa  47.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1020 aa  47.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 846 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  23.93 
 
 		 853 aa  46.6  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1276 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 		 854 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  22.56 
 
 		 891 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  30.42 
 
 		 689 aa  45.8  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 851 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.31 
 
 		 1009 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 868 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1051 aa  44.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  22.09 
 
 		 950 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>