143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1534 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
868 aa  1768    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
846 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  31.06 
 
 
717 aa  151  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  26.56 
 
 
903 aa  120  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.47 
 
 
2741 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 
2741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 
729 aa  112  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
916 aa  107  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
994 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
1711 aa  94.7  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  23.4 
 
 
919 aa  94.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.3 
 
 
532 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.32 
 
 
1328 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 
1060 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
1779 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
1247 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.99 
 
 
827 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 
1215 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  26.77 
 
 
1058 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.89 
 
 
1051 aa  79.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.69 
 
 
1007 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  23.74 
 
 
1219 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.27 
 
 
2637 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.9 
 
 
782 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.57 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.99 
 
 
991 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
1409 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  25.13 
 
 
992 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 
1507 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 
928 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  23.57 
 
 
853 aa  71.2  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 
851 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  25.76 
 
 
893 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
1276 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  26.97 
 
 
643 aa  68.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
880 aa  68.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
1186 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 
1162 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 
868 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.98 
 
 
1009 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.74 
 
 
3537 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  27.65 
 
 
884 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
1162 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
1276 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
1054 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
937 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  24.56 
 
 
1024 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  22.5 
 
 
909 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.73 
 
 
3535 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.73 
 
 
3419 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.5 
 
 
1650 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
796 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.28 
 
 
3298 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.34 
 
 
968 aa  64.7  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  29.76 
 
 
874 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.24 
 
 
828 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  27.44 
 
 
1247 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  26.9 
 
 
371 aa  62.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
854 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.8 
 
 
3299 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  24.93 
 
 
845 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  22.07 
 
 
809 aa  60.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  22.92 
 
 
944 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  28.88 
 
 
890 aa  60.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
923 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
1192 aa  58.5  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  29.03 
 
 
909 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
1448 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
1365 aa  57.8  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  28.16 
 
 
192 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  22.34 
 
 
891 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.25 
 
 
854 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 
985 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
811 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
1544 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  35 
 
 
1096 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.26 
 
 
1772 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
689 aa  55.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  29.44 
 
 
873 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 
1621 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  26.67 
 
 
1077 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  27.48 
 
 
811 aa  55.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.67 
 
 
1142 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 
890 aa  54.7  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  34.92 
 
 
848 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  24.37 
 
 
918 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  20.83 
 
 
960 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.71 
 
 
1266 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  21.59 
 
 
957 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.06 
 
 
1475 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  30.04 
 
 
905 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  29.37 
 
 
565 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 
636 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
1025 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  27 
 
 
883 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  35.09 
 
 
595 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  29.95 
 
 
1025 aa  52  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  24.54 
 
 
897 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  27.24 
 
 
751 aa  51.2  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
1028 aa  51.2  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>