66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1632 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 848 aa  1550    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  40.75 
 
 		 897 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  39.22 
 
 		 890 aa  333  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  39.36 
 
 		 873 aa  329  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  38.57 
 
 		 890 aa  319  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  38.52 
 
 		 811 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  39.8 
 
 		 874 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 902 aa  278  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  35.25 
 
 		 880 aa  223  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  34.18 
 
 		 595 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  37.28 
 
 		 905 aa  177  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 811 aa  170  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  33.54 
 
 		 883 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  39.88 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  32.15 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 916 aa  137  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  39.95 
 
 		 814 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  32.59 
 
 		 717 aa  89.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  47.76 
 
 		 861 aa  85.9  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 2741 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 2741 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 846 aa  80.9  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  28.35 
 
 		 959 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  27.03 
 
 		 918 aa  64.3  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 854 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1162 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 1162 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  31.1 
 
 		 853 aa  61.2  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  21.37 
 
 		 884 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.48 
 
 		 809 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  32.04 
 
 		 903 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  25.44 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.12 
 
 		 1007 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 851 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  32 
 
 		 827 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  35.29 
 
 		 447 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  40.7 
 
 		 1475 aa  55.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 1060 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.31 
 
 		 919 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 883 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.54 
 
 		 1009 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  29.22 
 
 		 992 aa  52  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1228 aa  51.6  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1544 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.45 
 
 		 893 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  39.89 
 
 		 960 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  36.07 
 
 		 699 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1261 aa  48.1  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  29.93 
 
 		 933 aa  47.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1077 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1215 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  30.63 
 
 		 192 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1096 aa  47  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1025 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 868 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 928 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  29.72 
 
 		 847 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 854 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.29 
 
 		 1650 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.72 
 
 		 1266 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 937 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 		 991 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.52 
 
 		 828 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 923 aa  44.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>