54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2965 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  100 
 
 		 883 aa  1702    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 811 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 880 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  32.72 
 
 		 595 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  31.63 
 
 		 890 aa  212  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  31.65 
 
 		 890 aa  207  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  33.05 
 
 		 873 aa  194  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  29.28 
 
 		 897 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  31.04 
 
 		 861 aa  163  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  31.61 
 
 		 874 aa  148  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 902 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  32.1 
 
 		 848 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  34.02 
 
 		 751 aa  125  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  34.98 
 
 		 811 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  35.24 
 
 		 814 aa  109  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 916 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  31.51 
 
 		 689 aa  98.2  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 		 905 aa  95.1  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 2741 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.37 
 
 		 2741 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  40.15 
 
 		 827 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  21.23 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.5 
 
 		 1007 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  31.03 
 
 		 959 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 1779 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1805 aa  55.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  24.22 
 
 		 893 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 846 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 1276 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1104 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.2 
 
 		 717 aa  52.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  35.29 
 
 		 960 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 868 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.18 
 
 		 809 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1060 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1247 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 729 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  23.96 
 
 		 992 aa  49.7  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1162 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  23.9 
 
 		 840 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1409 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1460 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.34 
 
 		 853 aa  47  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  25.8 
 
 		 2159 aa  47  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  25.89 
 
 		 918 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1365 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.7 
 
 		 991 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1051 aa  45.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.2 
 
 		 924 aa  45.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1142 aa  44.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 		 904 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1276 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>