119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2552 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  46.54 
 
 		 1142 aa  748    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  100 
 
 		 1104 aa  2155    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  45.57 
 
 		 1441 aa  733    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 		 1363 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  41.88 
 
 		 1096 aa  592  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 		 997 aa  519  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  33.83 
 
 		 1476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1076 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  34.13 
 
 		 1114 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07397  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 		 852 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1699  hypothetical protein  35.79 
 
 		 1127 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871536  normal  0.201111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1171 aa  362  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1147 aa  353  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1077 aa  350  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1051 aa  144  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  30.92 
 
 		 565 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 		 1507 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2673  hypothetical protein  34.38 
 
 		 912 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102629  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1058 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1199 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  24.79 
 
 		 799 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  29.27 
 
 		 521 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  22.64 
 
 		 747 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 878 aa  97.8  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.09 
 
 		 725 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.79 
 
 		 1044 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.51 
 
 		 810 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 1424 aa  89.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1105 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1779 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.52 
 
 		 827 aa  78.2  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1228 aa  75.1  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 924 aa  75.1  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 994 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  31.55 
 
 		 809 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  23.36 
 
 		 1219 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.9 
 
 		 1007 aa  71.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 916 aa  69.3  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.94 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  38.03 
 
 		 897 aa  67.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1241 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1276 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1068 aa  65.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.49 
 
 		 1050 aa  65.1  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 814 aa  65.1  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 2741 aa  65.1  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 2741 aa  64.7  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.04 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  22.8 
 
 		 1288 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  22.04 
 
 		 897 aa  62.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 505 aa  62  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  39.56 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  29.49 
 
 		 1141 aa  61.6  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 751 aa  60.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 1711 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.52 
 
 		 1186 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 885 aa  58.5  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 		 1128 aa  58.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.06 
 
 		 622 aa  57.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  21.81 
 
 		 992 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.77 
 
 		 784 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 880 aa  57  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  20.77 
 
 		 1488 aa  56.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  19.2 
 
 		 1262 aa  55.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.71 
 
 		 725 aa  55.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  33.8 
 
 		 595 aa  55.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  35.16 
 
 		 874 aa  54.7  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1055 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1060 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  43 
 
 		 822 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 		 1215 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  21.76 
 
 		 977 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 953 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  37.07 
 
 		 883 aa  53.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.99 
 
 		 818 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 		 1290 aa  52.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 1737 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 162 aa  52.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1268 aa  51.6  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.7 
 
 		 694 aa  50.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  22.75 
 
 		 934 aa  50.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 873 aa  50.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.54 
 
 		 1040 aa  50.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  21.78 
 
 		 1328 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  24.29 
 
 		 1475 aa  50.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.45 
 
 		 764 aa  50.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 991 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 991 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.56 
 
 		 1009 aa  49.3  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 284 aa  49.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  19.77 
 
 		 1185 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 		 854 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 905 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 905 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1119 aa  48.5  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  22.01 
 
 		 1125 aa  48.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 968 aa  48.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.48 
 
 		 532 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>