41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2123 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 751 aa  1468    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  35.04 
 
 		 689 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 880 aa  155  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  33.6 
 
 		 595 aa  154  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  39.31 
 
 		 890 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  36.78 
 
 		 873 aa  142  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  35.03 
 
 		 890 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 902 aa  134  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  45.61 
 
 		 848 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  30.42 
 
 		 897 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  34.15 
 
 		 883 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  40.85 
 
 		 814 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 811 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  31.86 
 
 		 874 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  36.32 
 
 		 905 aa  108  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 916 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  37.04 
 
 		 861 aa  64.3  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  27.45 
 
 		 992 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.86 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  29.13 
 
 		 827 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1051 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.24 
 
 		 1007 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.28 
 
 		 532 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  34.63 
 
 		 1013 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1247 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  28.63 
 
 		 811 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1779 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1247 aa  50.8  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 868 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  36.45 
 
 		 1029 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  38.89 
 
 		 1142 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.42 
 
 		 2741 aa  47.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.42 
 
 		 2741 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  35.79 
 
 		 1017 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 		 1162 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 1162 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1441 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1096 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1104 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1008  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 946 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366493  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 907 aa  44.3  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>