77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1984 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  100 
 
 
959 aa  1932    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  31.76 
 
 
918 aa  335  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 
2741 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.02 
 
 
2741 aa  99.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.31 
 
 
717 aa  82.4  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
916 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.27 
 
 
1162 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
880 aa  77.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
854 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
1162 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
846 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.72 
 
 
532 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 
729 aa  71.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
1025 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 
968 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  30.09 
 
 
890 aa  68.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  26.54 
 
 
874 aa  65.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  30.13 
 
 
890 aa  65.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  27.62 
 
 
853 aa  63.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.96 
 
 
893 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.59 
 
 
3299 aa  61.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  24.84 
 
 
811 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
1036 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  27.82 
 
 
595 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
1409 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  19.74 
 
 
1054 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  31.03 
 
 
883 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  35.09 
 
 
1475 aa  56.6  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.29 
 
 
1009 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
937 aa  55.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  28.65 
 
 
1142 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
902 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  31.52 
 
 
1025 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
897 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  34.62 
 
 
689 aa  54.3  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 
1060 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 
809 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.59 
 
 
3537 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.95 
 
 
884 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  30.06 
 
 
1039 aa  53.5  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.38 
 
 
1772 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  28.29 
 
 
848 aa  52.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
851 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
811 aa  53.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
1544 aa  53.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  30.3 
 
 
1051 aa  52.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.53 
 
 
1328 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.27 
 
 
3298 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  28.72 
 
 
447 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
1448 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  27.33 
 
 
192 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
928 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
861 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.88 
 
 
3535 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.88 
 
 
3419 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  34.35 
 
 
827 aa  50.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.18 
 
 
919 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
1621 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
736 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  28.65 
 
 
989 aa  48.9  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.82 
 
 
1650 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
868 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 
873 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  27.34 
 
 
1266 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  28.35 
 
 
891 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  21.88 
 
 
909 aa  45.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.52 
 
 
944 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.87 
 
 
840 aa  45.8  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.38 
 
 
1238 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  25.21 
 
 
553 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  29.9 
 
 
1024 aa  45.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  31.32 
 
 
1051 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 
854 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  24.88 
 
 
960 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  29.6 
 
 
1147 aa  44.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.36 
 
 
992 aa  44.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  25.64 
 
 
1246 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>