86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7063 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  100 
 
 		 811 aa  1543    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  53.02 
 
 		 814 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  33.09 
 
 		 890 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  32.82 
 
 		 890 aa  244  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  37.43 
 
 		 595 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  39.94 
 
 		 873 aa  167  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 811 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 		 880 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  42.28 
 
 		 848 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  34.44 
 
 		 897 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  39.74 
 
 		 689 aa  154  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 902 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  37.3 
 
 		 874 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  36.59 
 
 		 905 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  34.98 
 
 		 883 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 		 916 aa  108  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 		 2741 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.72 
 
 		 2741 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  32.67 
 
 		 861 aa  74.7  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 846 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1162 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.52 
 
 		 1162 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 729 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.69 
 
 		 717 aa  68.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  33.14 
 
 		 827 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.03 
 
 		 968 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  26.09 
 
 		 959 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1060 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  30.92 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  34.65 
 
 		 532 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.92 
 
 		 828 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1409 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1142 aa  56.6  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  29.67 
 
 		 751 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  36.21 
 
 		 853 aa  56.6  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 854 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.62 
 
 		 992 aa  55.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1241 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 868 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  33.06 
 
 		 960 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37 
 
 		 1475 aa  54.7  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  28.81 
 
 		 891 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.15 
 
 		 1328 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  34.11 
 
 		 903 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  37.84 
 
 		 447 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.73 
 
 		 1009 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  27.93 
 
 		 371 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.81 
 
 		 884 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1054 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  34.18 
 
 		 1228 aa  53.5  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 868 aa  52.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 854 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  32.26 
 
 		 565 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.51 
 
 		 893 aa  50.8  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 937 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  24.32 
 
 		 840 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  33.59 
 
 		 950 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.7 
 
 		 919 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  33.59 
 
 		 950 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  25.54 
 
 		 918 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.78 
 
 		 3535 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.65 
 
 		 3298 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.78 
 
 		 3419 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 994 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  21.62 
 
 		 909 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 991 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 1365 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1711 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.04 
 
 		 3537 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 883 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.31 
 
 		 904 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 		 918 aa  46.6  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1104 aa  46.2  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  34.11 
 
 		 659 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  35.79 
 
 		 937 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1441 aa  45.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  31.97 
 
 		 989 aa  45.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1448 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.04 
 
 		 3299 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1025 aa  45.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.7 
 
 		 2637 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  37.76 
 
 		 960 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 796 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1077 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>