50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6030 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 880 aa  1681    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  35.67 
 
 		 595 aa  306  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  31.91 
 
 		 897 aa  265  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  34.82 
 
 		 873 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  33.18 
 
 		 890 aa  251  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  33.06 
 
 		 890 aa  235  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 811 aa  235  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  33.99 
 
 		 883 aa  229  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  32.58 
 
 		 874 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 902 aa  207  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  34.83 
 
 		 848 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  38.32 
 
 		 811 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  37.38 
 
 		 751 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  33.12 
 
 		 905 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  36.51 
 
 		 689 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  37.84 
 
 		 814 aa  107  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  32.83 
 
 		 861 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 916 aa  85.9  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 846 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  27.51 
 
 		 959 aa  78.2  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  29.52 
 
 		 717 aa  75.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 2741 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.98 
 
 		 2741 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 868 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 729 aa  67.8  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  35.71 
 
 		 827 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  27.51 
 
 		 918 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1104 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1051 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1060 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1409 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.46 
 
 		 893 aa  51.6  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 991 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.7 
 
 		 1007 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1142 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  26.88 
 
 		 891 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  32.77 
 
 		 960 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  32.09 
 
 		 903 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1228 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  30 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1460 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 937 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1147 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.76 
 
 		 447 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  34.78 
 
 		 2637 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  27.13 
 
 		 532 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 854 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  34.96 
 
 		 1241 aa  45.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  29.44 
 
 		 371 aa  44.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.63 
 
 		 809 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>