86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2373 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  100 
 
 
918 aa  1851    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  31.33 
 
 
959 aa  330  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.64 
 
 
717 aa  92.4  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
729 aa  86.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
916 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.57 
 
 
418 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 
2741 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 
2741 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
1025 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  25.79 
 
 
3299 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
1162 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.63 
 
 
968 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.5 
 
 
1162 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
846 aa  66.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.35 
 
 
893 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  25.97 
 
 
890 aa  63.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
937 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.17 
 
 
1650 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  25.53 
 
 
447 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  26.07 
 
 
950 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  25.12 
 
 
874 aa  61.6  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.57 
 
 
3537 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
902 aa  61.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.54 
 
 
853 aa  61.2  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  26.07 
 
 
950 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.95 
 
 
3298 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  34.29 
 
 
1475 aa  59.7  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  27.11 
 
 
903 aa  59.3  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.57 
 
 
3535 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.57 
 
 
3419 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.08 
 
 
809 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  34.88 
 
 
1051 aa  57  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  30.2 
 
 
897 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
880 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
1028 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  28.97 
 
 
643 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
923 aa  55.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  23.5 
 
 
553 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
851 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  30.58 
 
 
890 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.4 
 
 
884 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  30.54 
 
 
989 aa  55.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
868 aa  54.7  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
868 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  23.96 
 
 
873 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.37 
 
 
937 aa  53.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  24.69 
 
 
595 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
1779 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.31 
 
 
1772 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 
854 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
905 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
905 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  31.1 
 
 
1025 aa  51.6  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
928 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  27.82 
 
 
909 aa  51.2  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.25 
 
 
1009 aa  51.2  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
1409 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  26.44 
 
 
891 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  25.54 
 
 
811 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  31.3 
 
 
848 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  29.68 
 
 
840 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  24.45 
 
 
905 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.35 
 
 
828 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 
1247 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 
919 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  23.14 
 
 
960 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
854 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
1365 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  29.92 
 
 
1039 aa  48.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
1036 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
1060 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
811 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  26.23 
 
 
1077 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
1544 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  31.4 
 
 
877 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  34.43 
 
 
1228 aa  46.6  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  36.9 
 
 
1328 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
1215 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  25.89 
 
 
883 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
1054 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 
1186 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  26.17 
 
 
1024 aa  45.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.07 
 
 
991 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  24.51 
 
 
992 aa  44.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  33.66 
 
 
861 aa  44.3  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 
1429 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>