108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1164 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1221    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
916 aa  111  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  31.58 
 
 
717 aa  107  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.23 
 
 
532 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  27.99 
 
 
903 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  42.99 
 
 
937 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
1054 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
729 aa  87.8  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 
2741 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
868 aa  84.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 
2741 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45 
 
 
968 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  32.11 
 
 
811 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
1162 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 
1162 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
1409 aa  77  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
1025 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
854 aa  73.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.51 
 
 
919 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  42.06 
 
 
923 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
1779 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  25.88 
 
 
918 aa  70.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
1215 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  24.74 
 
 
1219 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
1247 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 
846 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.05 
 
 
1009 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  20.41 
 
 
884 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.48 
 
 
1328 aa  67.4  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
1365 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  31.29 
 
 
893 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  28.63 
 
 
595 aa  65.1  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
851 aa  64.3  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  43.53 
 
 
1507 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37.61 
 
 
1475 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  40.69 
 
 
1228 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.59 
 
 
3298 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.99 
 
 
3535 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.99 
 
 
3419 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
868 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  26.44 
 
 
944 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
902 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.99 
 
 
3537 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  30.77 
 
 
853 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  33.9 
 
 
447 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  34.07 
 
 
814 aa  59.7  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.61 
 
 
1007 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.81 
 
 
809 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
1276 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  38.21 
 
 
827 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  26.95 
 
 
1024 aa  58.2  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 
854 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.62 
 
 
3299 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  28.03 
 
 
847 aa  57.4  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.58 
 
 
2637 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.97 
 
 
418 aa  57.4  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
883 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.17 
 
 
828 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.83 
 
 
992 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
851 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.3 
 
 
950 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
905 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.86 
 
 
950 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
905 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  31.05 
 
 
874 aa  54.7  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
796 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  30.74 
 
 
1241 aa  53.9  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
1544 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
928 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  30.81 
 
 
989 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.88 
 
 
1650 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 
1711 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  31.96 
 
 
1268 aa  52.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  26.16 
 
 
890 aa  52  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  28.81 
 
 
960 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  24.75 
 
 
1259 aa  51.2  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
822 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  37.29 
 
 
565 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  33.62 
 
 
1051 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  26.72 
 
 
959 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  20.11 
 
 
1060 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  34.27 
 
 
909 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.73 
 
 
991 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 
1186 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.1 
 
 
1266 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  26.64 
 
 
698 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.54 
 
 
1772 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
1621 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 
725 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  29.28 
 
 
1058 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6701  hypothetical protein  29.57 
 
 
675 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
1448 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
1055 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  27.31 
 
 
890 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  29.79 
 
 
659 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  23.85 
 
 
891 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  30.58 
 
 
848 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  29.27 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
880 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>