77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2387 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  45.31 
 
 		 1036 aa  816    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  44.93 
 
 		 1039 aa  756    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  100 
 
 		 1051 aa  2112    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  48.18 
 
 		 1025 aa  831    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1024 aa  129  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  35.28 
 
 		 937 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.84 
 
 		 1135 aa  95.5  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  32.48 
 
 		 989 aa  94.7  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 1162 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1025 aa  93.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 		 1162 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 916 aa  91.3  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  28.98 
 
 		 877 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  37.37 
 
 		 934 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 868 aa  83.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.24 
 
 		 1009 aa  79.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 729 aa  77.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 968 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1028 aa  73.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 846 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  29.83 
 
 		 944 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1060 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.02 
 
 		 809 aa  71.6  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  35.22 
 
 		 893 aa  71.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.4 
 
 		 957 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  32.94 
 
 		 532 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  27.57 
 
 		 950 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  35.94 
 
 		 717 aa  70.1  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  27.57 
 
 		 950 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 2741 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 822 aa  68.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 923 aa  67.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1246 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 2741 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.37 
 
 		 854 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 796 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 		 904 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  21.09 
 
 		 884 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23 
 
 		 991 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.23 
 
 		 960 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 905 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 905 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  35.43 
 
 		 919 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 851 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  25.26 
 
 		 891 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  25.87 
 
 		 853 aa  62.4  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 1215 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  35.43 
 
 		 1328 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  30.53 
 
 		 1475 aa  62  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 1054 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 937 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 883 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 851 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1365 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  34.88 
 
 		 918 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.76 
 
 		 828 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  29.14 
 
 		 903 aa  55.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.08 
 
 		 840 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1409 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  25.56 
 
 		 192 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  30.3 
 
 		 959 aa  52.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1055 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  24.66 
 
 		 725 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 767 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 868 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 928 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 885 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  25.89 
 
 		 874 aa  46.6  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 		 1186 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  26.77 
 
 		 1772 aa  46.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1105 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  29.31 
 
 		 121 aa  45.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 		 725 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1878 aa  45.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1259 aa  45.1  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  21.93 
 
 		 1247 aa  45.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>