39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1492 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  100 
 
 
1259 aa  2565    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
916 aa  90.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  26.5 
 
 
989 aa  88.2  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  25.25 
 
 
532 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.33 
 
 
937 aa  79.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  24.4 
 
 
1024 aa  79  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  27.18 
 
 
934 aa  78.2  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  28.75 
 
 
877 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
1054 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 
1215 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 
893 aa  62  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.91 
 
 
1328 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 
854 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 
919 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
1025 aa  57.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  26.53 
 
 
845 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
1162 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.13 
 
 
1162 aa  55.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
1028 aa  54.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37 
 
 
968 aa  53.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 
1135 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 
822 aa  51.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
905 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  22.78 
 
 
1039 aa  50.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
905 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  21.9 
 
 
903 aa  49.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 
1060 aa  48.5  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
1186 aa  48.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  21.23 
 
 
883 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.75 
 
 
991 aa  48.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  23.98 
 
 
1025 aa  47.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.2 
 
 
884 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
1055 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  22.84 
 
 
960 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 
2741 aa  45.8  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  28.33 
 
 
643 aa  45.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  23.28 
 
 
1051 aa  45.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
937 aa  45.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 
2741 aa  45.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>