121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2808 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 883 aa  1802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.65 
 
 		 854 aa  363  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  31.06 
 
 		 944 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  37.04 
 
 		 891 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  32.15 
 
 		 885 aa  344  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 868 aa  337  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 905 aa  332  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 905 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  37.66 
 
 		 950 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  36.56 
 
 		 950 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 851 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  31.52 
 
 		 845 aa  317  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.49 
 
 		 904 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 796 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  30.33 
 
 		 853 aa  308  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  34.85 
 
 		 960 aa  306  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  31.16 
 
 		 840 aa  303  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 822 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  29.43 
 
 		 725 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  28.21 
 
 		 698 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.09 
 
 		 3298 aa  167  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.51 
 
 		 447 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.59 
 
 		 3419 aa  166  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.59 
 
 		 3535 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.97 
 
 		 957 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.25 
 
 		 3537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.81 
 
 		 1650 aa  161  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.34 
 
 		 3299 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.76 
 
 		 1772 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  31.56 
 
 		 809 aa  154  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.95 
 
 		 2637 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  29.75 
 
 		 1009 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  30.91 
 
 		 418 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 949 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  31.31 
 
 		 553 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1060 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 		 991 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 828 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  37.95 
 
 		 192 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.82 
 
 		 717 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.15 
 
 		 1328 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.82 
 
 		 919 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 1162 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1162 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1215 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 916 aa  89  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 968 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  27.09 
 
 		 884 aa  85.5  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  28.24 
 
 		 903 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.9 
 
 		 532 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 851 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 		 2741 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  38.6 
 
 		 121 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.22 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 2741 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1025 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.25 
 
 		 1007 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 854 aa  71.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.59 
 
 		 782 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  30 
 
 		 1051 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 846 aa  67  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1024 aa  66.6  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 1276 aa  65.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  23.89 
 
 		 893 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 1409 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 937 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1192 aa  64.3  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1365 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1711 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 923 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1276 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1055 aa  62  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1025 aa  61.6  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 1054 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36.79 
 
 		 1475 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  26.27 
 
 		 565 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  26.03 
 
 		 874 aa  60.1  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1051 aa  59.3  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 1036 aa  59.3  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1039 aa  58.9  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.88 
 
 		 1186 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6701  hypothetical protein  25 
 
 		 675 aa  57.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  28.93 
 
 		 364 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 1266 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1228 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1448 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 1779 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1544 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  27.52 
 
 		 909 aa  54.7  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  33.96 
 
 		 989 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1246 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1247 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1238 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  36 
 
 		 937 aa  52.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  26.29 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  20.91 
 
 		 1313 aa  51.2  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1621 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  24.79 
 
 		 992 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.61 
 
 		 985 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>