170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1380 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 937 aa  1807    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  38.59 
 
 		 934 aa  402  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  33.45 
 
 		 989 aa  266  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 1028 aa  234  6e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  31.56 
 
 		 1024 aa  154  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37 
 
 		 1135 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  27.73 
 
 		 877 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.92 
 
 		 1186 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  35.28 
 
 		 1051 aa  114  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1025 aa  110  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1039 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 444 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 1025 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1039 aa  99  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 767 aa  97.8  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.82 
 
 		 1288 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 787 aa  96.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1036 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1105 aa  94.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 454 aa  94.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  29.26 
 
 		 311 aa  94.7  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 		 1424 aa  94  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 923 aa  93.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 568 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.02 
 
 		 568 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 924 aa  90.9  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 843 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 751 aa  88.2  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.7 
 
 		 725 aa  87.8  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 771 aa  86.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.38 
 
 		 532 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  34.65 
 
 		 1328 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 911 aa  87  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.18 
 
 		 672 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 953 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  21.73 
 
 		 1507 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  35.68 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 		 991 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1215 aa  81.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 814 aa  81.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  20.89 
 
 		 822 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 443 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1259 aa  80.1  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  29.26 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1365 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 1162 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1162 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1054 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.21 
 
 		 2741 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 		 2741 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1409 aa  75.1  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.32 
 
 		 1131 aa  74.7  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  23.34 
 
 		 799 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 729 aa  73.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 190 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 		 1290 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.49 
 
 		 1050 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 667 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 968 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 		 885 aa  72  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.67 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  26.48 
 
 		 1056 aa  71.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 937 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 949 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  22.05 
 
 		 1262 aa  68.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 916 aa  68.6  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  20.56 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  23.96 
 
 		 977 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 		 893 aa  67.8  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.69 
 
 		 1044 aa  67.8  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  28.76 
 
 		 1475 aa  67.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  21.66 
 
 		 825 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  35.96 
 
 		 717 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  18.75 
 
 		 1550 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 851 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  27.45 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 837 aa  63.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  19.05 
 
 		 2145 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 796 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 854 aa  62.4  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.57 
 
 		 854 aa  62.4  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  23.08 
 
 		 1488 aa  61.6  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  21.31 
 
 		 680 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  21.48 
 
 		 884 aa  61.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  23.14 
 
 		 577 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 		 1479 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  25.77 
 
 		 963 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.96 
 
 		 991 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  32.28 
 
 		 903 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  21.4 
 
 		 857 aa  58.9  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 		 899 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  20.86 
 
 		 1125 aa  58.2  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.02 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.65 
 
 		 854 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  29.01 
 
 		 845 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1060 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>