166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4959 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  54.74 
 
 
1219 aa  741    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  62.33 
 
 
1779 aa  1334    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  81.01 
 
 
1321 aa  1177    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  55.39 
 
 
1711 aa  1275    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  76.07 
 
 
1083 aa  941    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  55.59 
 
 
1448 aa  1129    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  80.88 
 
 
1247 aa  917    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  78.45 
 
 
1621 aa  2521    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
1544 aa  3173    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  34.58 
 
 
1266 aa  592  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  54.83 
 
 
994 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
1911 aa  376  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  49.76 
 
 
552 aa  367  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.17 
 
 
992 aa  358  5.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  44.9 
 
 
393 aa  321  7e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  33.95 
 
 
1141 aa  297  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  40.04 
 
 
724 aa  257  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.7 
 
 
934 aa  239  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  30.29 
 
 
982 aa  213  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  39.02 
 
 
599 aa  206  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  41.57 
 
 
596 aa  198  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 
1694 aa  192  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  54.4 
 
 
422 aa  186  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
878 aa  181  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 
810 aa  160  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  34.29 
 
 
714 aa  145  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  23.82 
 
 
962 aa  145  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 
1288 aa  142  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 
1869 aa  139  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
1502 aa  138  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  31.75 
 
 
720 aa  134  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  36.21 
 
 
476 aa  125  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
916 aa  122  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  29.71 
 
 
737 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.84 
 
 
1328 aa  119  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  22.71 
 
 
1007 aa  115  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
1060 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 
1450 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  25.68 
 
 
985 aa  112  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  34.63 
 
 
720 aa  108  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0606  hypothetical protein  34.91 
 
 
199 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 
2741 aa  103  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
1276 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 
2741 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  30.9 
 
 
1363 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  21.62 
 
 
957 aa  95.9  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.2 
 
 
1507 aa  96.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  24.33 
 
 
1476 aa  92.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  32.06 
 
 
560 aa  90.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
454 aa  90.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  33.88 
 
 
341 aa  90.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 
991 aa  90.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 
949 aa  89.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  31.39 
 
 
322 aa  89.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  31.39 
 
 
322 aa  89.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.97 
 
 
644 aa  89  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  31.69 
 
 
1131 aa  87.4  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  33.8 
 
 
326 aa  87.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  31.58 
 
 
325 aa  87  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.28 
 
 
725 aa  86.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.49 
 
 
733 aa  83.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26.19 
 
 
490 aa  83.2  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.11 
 
 
828 aa  82  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  23.4 
 
 
1058 aa  81.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 
985 aa  79.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  32.08 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  32.08 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  34.48 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 
1276 aa  79  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.21 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
412 aa  77.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  24.38 
 
 
717 aa  77.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  27.92 
 
 
460 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  26.07 
 
 
827 aa  76.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
1192 aa  75.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  34.66 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 
1186 aa  75.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 
991 aa  75.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  32.32 
 
 
325 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  30 
 
 
332 aa  73.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
649 aa  74.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  29.55 
 
 
445 aa  73.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
1215 aa  73.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 
568 aa  71.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
843 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
568 aa  71.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.42 
 
 
1040 aa  70.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  25.81 
 
 
565 aa  70.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.21 
 
 
1238 aa  68.6  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.62 
 
 
884 aa  68.6  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 
767 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.01 
 
 
771 aa  67  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 
997 aa  66.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
1025 aa  66.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.7 
 
 
782 aa  66.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1074  hypothetical protein  31.13 
 
 
416 aa  65.9  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0537877  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  27.71 
 
 
371 aa  65.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  21.08 
 
 
809 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  34.75 
 
 
501 aa  64.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  33.08 
 
 
405 aa  63.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>