94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1908 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 		 962 aa  1941    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.31 
 
 		 934 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1911 aa  257  8e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  26.76 
 
 		 982 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 1621 aa  144  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26.63 
 
 		 490 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  26.05 
 
 		 460 aa  141  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  24.48 
 
 		 1219 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  20.87 
 
 		 1141 aa  122  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.14 
 
 		 992 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 994 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  20.73 
 
 		 724 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  27.68 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  22.97 
 
 		 599 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1711 aa  78.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  25.28 
 
 		 737 aa  77.4  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  21.26 
 
 		 596 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1779 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 422 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  25.16 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  28.69 
 
 		 259 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  25.94 
 
 		 552 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1083 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  26.5 
 
 		 720 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1448 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1502 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  23.02 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  28.03 
 
 		 216 aa  64.3  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  25.95 
 
 		 720 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.62 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  22.06 
 
 		 714 aa  63.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.83 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  23.94 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  21.28 
 
 		 298 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  26.96 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  30.41 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  30.41 
 
 		 326 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1544 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  26.24 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1321 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  24.83 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  31.51 
 
 		 337 aa  57.4  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  26.17 
 
 		 113 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  21.09 
 
 		 907 aa  57  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  27.1 
 
 		 267 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  25.81 
 
 		 266 aa  56.2  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  20.07 
 
 		 445 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 1247 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  24.83 
 
 		 450 aa  56.2  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  30.43 
 
 		 325 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  24 
 
 		 276 aa  55.5  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  23.57 
 
 		 331 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  21.28 
 
 		 554 aa  55.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  30.89 
 
 		 322 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  23.89 
 
 		 495 aa  55.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  33.62 
 
 		 326 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  30.89 
 
 		 322 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  26.85 
 
 		 262 aa  54.7  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  21.43 
 
 		 456 aa  53.5  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  24.11 
 
 		 574 aa  53.5  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1869 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  22.19 
 
 		 2327 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  24.56 
 
 		 426 aa  52.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  21.77 
 
 		 454 aa  51.6  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  26.99 
 
 		 950 aa  51.2  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2800  hypothetical protein  23.66 
 
 		 720 aa  51.2  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000115328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  30.06 
 
 		 327 aa  51.2  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  28.37 
 
 		 501 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  20.74 
 
 		 478 aa  50.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  21.77 
 
 		 423 aa  50.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  28.44 
 
 		 529 aa  50.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  22.22 
 
 		 948 aa  49.7  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  26.92 
 
 		 366 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  24.77 
 
 		 741 aa  49.3  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  24.4 
 
 		 425 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  28.04 
 
 		 418 aa  48.5  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  22.43 
 
 		 175 aa  48.1  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  23.87 
 
 		 435 aa  48.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3809  hypothetical protein  24.34 
 
 		 405 aa  48.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  21.13 
 
 		 451 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  23.08 
 
 		 549 aa  47.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  25 
 
 		 292 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  21.99 
 
 		 476 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  25.42 
 
 		 298 aa  47.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  25.22 
 
 		 429 aa  47.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 817 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  23.31 
 
 		 502 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.52 
 
 		 1279 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  25.35 
 
 		 451 aa  45.8  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1253  hypothetical protein  19.21 
 
 		 458 aa  45.8  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.238596  normal  0.0174069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 533 aa  45.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  23.08 
 
 		 281 aa  45.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  26.38 
 
 		 332 aa  44.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.09 
 
 		 2145 aa  44.3  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>