15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2800 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2800  hypothetical protein  100 
 
 		 720 aa  1447    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000115328 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1911 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2801  hypothetical protein  49.44 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  hitchhiker  0.0000289447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.19 
 
 		 934 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  30.18 
 
 		 552 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 994 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  27.76 
 
 		 982 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1869 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  27.24 
 
 		 724 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  26.82 
 
 		 1219 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  23.66 
 
 		 962 aa  51.2  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  27.78 
 
 		 596 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  26.87 
 
 		 720 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1371 aa  47.8  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1502 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>