More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1413 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 533 aa  1066    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  42.99 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 538 aa  274  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 538 aa  269  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 596 aa  187  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 685 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 909 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.03 
 
 		 875 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 602 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 1737 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 878 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.11 
 
 		 810 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  29.19 
 
 		 272 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1138 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.02 
 
 		 816 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 827 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.14 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 3145 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  31.14 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.17 
 
 		 622 aa  63.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 927 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 762 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 602 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.63 
 
 		 2240 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.54 
 
 		 620 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 1486 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  26.11 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.37 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.19 
 
 		 865 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.71 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 243 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 725 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 612 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 614 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 626 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 614 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 614 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  23.44 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.17 
 
 		 764 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 614 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  30.65 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 689 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1450 aa  60.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 1276 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 4079 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 366 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 714 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.8 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 750 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  32.04 
 
 		 661 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.14 
 
 		 1154 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.81 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 		 1213 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 955 aa  57.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 646 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 1252 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 1252 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.78 
 
 		 1979 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 637 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 		 1694 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  37.76 
 
 		 435 aa  57  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1094 aa  57  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  33.33 
 
 		 623 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>