More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1061 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
538 aa  1060    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  94.05 
 
 
538 aa  983    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1413  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 
533 aa  277  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0169932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0311  TPR repeat-containing protein  48.69 
 
 
513 aa  269  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0753033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0402  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
596 aa  197  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.48 
 
 
632 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
685 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
681 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 
810 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
878 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
909 aa  93.6  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.38 
 
 
865 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.46 
 
 
603 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
739 aa  91.3  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 
637 aa  90.1  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
750 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
3145 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.79 
 
 
725 aa  87.8  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.61 
 
 
816 aa  87  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
583 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
927 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
750 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.43 
 
 
267 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
955 aa  83.2  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
1276 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  31.44 
 
 
887 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.48 
 
 
622 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
4079 aa  80.1  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.19 
 
 
795 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.01 
 
 
732 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
3301 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
1486 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 
1094 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
1737 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
3172 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.82 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.11 
 
 
764 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.84 
 
 
1694 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.49 
 
 
784 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
4489 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
3035 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.93 
 
 
623 aa  74.7  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
543 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  30.41 
 
 
594 aa  73.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.86 
 
 
733 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.23 
 
 
714 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 
1979 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.82 
 
 
707 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 
311 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3560 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.61 
 
 
875 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
634 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
711 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 
573 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 
557 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
542 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 
2240 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.84 
 
 
745 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
505 aa  70.5  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.55 
 
 
676 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 
550 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 
329 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.83 
 
 
265 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
265 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.12 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.77 
 
 
1764 aa  68.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.5 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
1106 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.63 
 
 
586 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  32.05 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
639 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.75 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.35 
 
 
576 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
718 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.68 
 
 
979 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
612 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.3 
 
 
1007 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.88 
 
 
837 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
762 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
1069 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.78 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.78 
 
 
626 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  31.25 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.39 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
1827 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>