More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1957 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
375 aa  738    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
377 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 
362 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.3 
 
 
745 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
543 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
1276 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  33.77 
 
 
299 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 
2240 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 
927 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.47 
 
 
810 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
878 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
632 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
465 aa  86.7  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 
383 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.43 
 
 
818 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
602 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.86 
 
 
1979 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
955 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
3035 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.46 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
620 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.59 
 
 
1056 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.91 
 
 
1007 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.75 
 
 
576 aa  76.6  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.91 
 
 
1009 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 
3145 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
4489 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.24 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.16 
 
 
1022 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
935 aa  73.9  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
711 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 
836 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
685 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 
1694 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
562 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
3560 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
1069 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.84 
 
 
626 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.43 
 
 
988 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.78 
 
 
784 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
592 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.32 
 
 
2145 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 
1186 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
715 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.16 
 
 
573 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1051  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
538 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
503 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.08 
 
 
887 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
4079 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.71 
 
 
566 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 
667 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
1297 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.79 
 
 
292 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  25.65 
 
 
897 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
612 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
639 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
617 aa  66.2  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
615 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
523 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.37 
 
 
689 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
636 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
1406 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
1106 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.29 
 
 
1067 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
611 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1061  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
538 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000210064  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.46 
 
 
1056 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
344 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
591 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
635 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
635 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26.22 
 
 
623 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
762 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 
637 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
467 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
288 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
750 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
245 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.89 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
824 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.31 
 
 
635 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
221 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.27 
 
 
1550 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.43 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
740 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
629 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  29.95 
 
 
240 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
250 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
700 aa  62  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
681 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
594 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>