More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1753 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1753  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 362 aa  739    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  38.48 
 
 		 377 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  33.19 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 1276 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 543 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.31 
 
 		 1694 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.96 
 
 		 1007 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 878 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 955 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 3035 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 		 632 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.74 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1069 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 602 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 		 810 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.6 
 
 		 745 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 4489 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 4079 aa  102  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 927 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 836 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 711 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 448 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 3560 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.57 
 
 		 576 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 523 aa  94  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.35 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1138 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1121 aa  93.6  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 562 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.66 
 
 		 615 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 		 1056 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.79 
 
 		 1056 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 465 aa  89.7  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.43 
 
 		 707 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27.05 
 
 		 623 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 244 aa  88.6  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.36 
 
 		 1979 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 747 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 592 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 608 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.14 
 
 		 818 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 		 988 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 202 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 245 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 515 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 740 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.71 
 
 		 784 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 352 aa  86.7  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 793 aa  85.9  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  25.71 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 1094 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.07 
 
 		 620 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1297 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.45 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 614 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.7 
 
 		 626 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 614 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.32 
 
 		 1022 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 784 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 740 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 		 1737 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 639 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 		 626 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.43 
 
 		 635 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 635 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 635 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 542 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.31 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 637 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 620 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.24 
 
 		 626 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 617 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  24.02 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.54 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 662 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.24 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 503 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.24 
 
 		 614 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 466 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 935 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1276 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 716 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.34 
 
 		 887 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 715 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 1486 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>