138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2424 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  35.51 
 
 
259 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  55.56 
 
 
113 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  41.01 
 
 
452 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  38.03 
 
 
450 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  45.59 
 
 
216 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.91 
 
 
907 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  38 
 
 
483 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  46.67 
 
 
495 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  50.52 
 
 
732 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  44.44 
 
 
591 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  36.84 
 
 
323 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  40.58 
 
 
298 aa  99  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  42.86 
 
 
175 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 
418 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  47.73 
 
 
480 aa  89  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  36.94 
 
 
948 aa  87  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  37.59 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  34.46 
 
 
451 aa  85.9  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  41.18 
 
 
535 aa  85.9  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  45.36 
 
 
263 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  36.03 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  39.84 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  35.46 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  35.46 
 
 
269 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  31.44 
 
 
451 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  47.06 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.03 
 
 
657 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  32.91 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  43.56 
 
 
478 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  33.77 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  30.57 
 
 
502 aa  82  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  44.44 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  40 
 
 
950 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  37.41 
 
 
269 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  40.78 
 
 
741 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 
650 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  43.33 
 
 
514 aa  81.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  38.38 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  32.89 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  32.5 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  42.72 
 
 
1305 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  35.14 
 
 
521 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  33.86 
 
 
792 aa  79.3  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  32.89 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  36.11 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  35.37 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  28.93 
 
 
414 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  39.6 
 
 
1176 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  33.75 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  37.37 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  38.1 
 
 
625 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  45.26 
 
 
845 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  39.62 
 
 
383 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  39.39 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  31.69 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  40.57 
 
 
758 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  40.59 
 
 
763 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  28.09 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  44 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  30.19 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  29.73 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  32.5 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  37.14 
 
 
704 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  38.1 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  38.32 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  36.27 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 
429 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  38.94 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  40.57 
 
 
547 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  34.81 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  35.77 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  38.3 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  36.19 
 
 
458 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  33.11 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  40.4 
 
 
784 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  30.77 
 
 
421 aa  68.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  33.61 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.72 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  32.28 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  33.57 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  26.53 
 
 
549 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  38.61 
 
 
529 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  42.35 
 
 
553 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
657 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  38.46 
 
 
781 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  28.78 
 
 
450 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  32.53 
 
 
501 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  32.46 
 
 
652 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  32.06 
 
 
554 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  33.91 
 
 
1118 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 
746 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1228  copper amine oxidase-like  27.62 
 
 
559 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175473  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  33.94 
 
 
372 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  25.32 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
718 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  29 
 
 
447 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  27.61 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  33.65 
 
 
754 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  36.19 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>