139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1988 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1139    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  44.5 
 
 		 428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  38.66 
 
 		 526 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3479  protein of unknown function DUF1533  39.21 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  36.75 
 
 		 625 aa  113  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1987  hypothetical protein  27.89 
 
 		 612 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000259198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  36.54 
 
 		 113 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1966  hypothetical protein  26.29 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  32.53 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  27.78 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  32.53 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  47.5 
 
 		 1821 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  36.07 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  27.61 
 
 		 591 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  34.35 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  45 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  32.5 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1968  hypothetical protein  33.14 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  24.62 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  40.43 
 
 		 1009 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  32 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  29.77 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  25.67 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.45 
 
 		 657 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  44.93 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  26.22 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  32.82 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  41.33 
 
 		 2638 aa  63.9  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  28.68 
 
 		 282 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  31.37 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  24.34 
 
 		 948 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  32.06 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  36.17 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  52.54 
 
 		 1418 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  36.59 
 
 		 574 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  24.16 
 
 		 269 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  47.06 
 
 		 1048 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  31.58 
 
 		 175 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  32.58 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  26.52 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  23.91 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  48.48 
 
 		 1732 aa  58.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.69 
 
 		 907 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  31.31 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  35.05 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  51.56 
 
 		 1937 aa  58.2  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  29.01 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  51.56 
 
 		 1467 aa  57.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  34.26 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  25.45 
 
 		 732 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  36.94 
 
 		 4630 aa  57.4  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  27.27 
 
 		 414 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  33.91 
 
 		 758 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  23.74 
 
 		 269 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  31.68 
 
 		 289 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  29.41 
 
 		 950 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  29.56 
 
 		 935 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 251 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  28.57 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  31.87 
 
 		 763 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  21.28 
 
 		 962 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  27.07 
 
 		 299 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  24.55 
 
 		 502 aa  55.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  27.08 
 
 		 259 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  28.87 
 
 		 418 aa  55.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  23.17 
 
 		 269 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  28.3 
 
 		 143 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  30.13 
 
 		 570 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  27.43 
 
 		 529 aa  53.9  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  29.79 
 
 		 460 aa  53.9  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  25.69 
 
 		 421 aa  53.5  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  30 
 
 		 781 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  32.04 
 
 		 331 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  40.79 
 
 		 981 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  41.67 
 
 		 306 aa  53.5  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  50.77 
 
 		 1226 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  30.08 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  30.69 
 
 		 320 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  24.1 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  26.73 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  28.28 
 
 		 704 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  26.67 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  28.92 
 
 		 754 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  26.42 
 
 		 1176 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  27.5 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  24.31 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  27.63 
 
 		 153 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  35.29 
 
 		 1077 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0480  copper amine oxidase domain-containing protein  30.95 
 
 		 243 aa  51.6  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000283762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  19.59 
 
 		 583 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.48 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  31.25 
 
 		 501 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  42.42 
 
 		 462 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  24.74 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  28.69 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  26.67 
 
 		 229 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  28 
 
 		 718 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>