44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2198 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2414  phage tail protein  39.91 
 
 		 217 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.029882  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2783  hypothetical protein  37.9 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1689  hypothetical protein  32.87 
 
 		 217 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.536925  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3408  tail protein 3  28.64 
 
 		 219 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3247  tail protein 3  30.69 
 
 		 228 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000278412  hitchhiker  0.000000000411211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1779  hypothetical protein  33.11 
 
 		 152 aa  86.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1625  hypothetical protein  31.1 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  60.98 
 
 		 1821 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  57.32 
 
 		 1009 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  49.51 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4087  tail protein 3  28.7 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  52.94 
 
 		 981 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  51.85 
 
 		 526 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  52.33 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2102  Ig-like domain-containing protein  50 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  50 
 
 		 428 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  45.24 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  52.17 
 
 		 1048 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  45 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  45.35 
 
 		 1418 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  35.58 
 
 		 1831 aa  56.2  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  45.87 
 
 		 1226 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  39.76 
 
 		 2638 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  43.9 
 
 		 1300 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  46.43 
 
 		 1467 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  46.43 
 
 		 1937 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  41.67 
 
 		 554 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  48.61 
 
 		 1732 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1076  gifsy-2 prophage VmtV  44.83 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.016765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1148  gifsy-2 prophage VmtV  44.83 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.781355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  34.48 
 
 		 576 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1413  gifsy-2 prophage VmtV  43.68 
 
 		 249 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000750798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3370  Ig domain-containing protein  38.14 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  38.1 
 
 		 1171 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  36.36 
 
 		 4630 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  40.23 
 
 		 600 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1665  Ig-like protein, group 2  42.86 
 
 		 462 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0449982 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  41.18 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0839  Ig-like, group 2  37.35 
 
 		 983 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1088  Ig domain-containing protein  36.14 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.704248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1068  Ig domain-containing protein  36.14 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.383445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  36.96 
 
 		 1965 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  33.67 
 
 		 1077 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>