142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2895 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 583 aa  1189    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  39.38 
 
 		 579 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 		 567 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  42.41 
 
 		 484 aa  262  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  32.99 
 
 		 444 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  29.24 
 
 		 374 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 		 793 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  31.46 
 
 		 358 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  27.17 
 
 		 316 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  28.96 
 
 		 343 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  28.12 
 
 		 542 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  27.92 
 
 		 420 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.25 
 
 		 1115 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  26.17 
 
 		 688 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 		 349 aa  103  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.25 
 
 		 1115 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  25.08 
 
 		 426 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.17 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 312 aa  97.8  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  26.83 
 
 		 356 aa  97.1  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  23.42 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  27.6 
 
 		 430 aa  96.3  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  27.44 
 
 		 356 aa  96.3  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.67 
 
 		 1115 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 307 aa  95.1  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.16 
 
 		 1119 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  24.84 
 
 		 1115 aa  92  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  26.09 
 
 		 423 aa  91.3  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 427 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  24.9 
 
 		 426 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 426 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  30.24 
 
 		 580 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  23.55 
 
 		 647 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  24.89 
 
 		 927 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  22.89 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  21.06 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  23.85 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  25.61 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  22.18 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  24.31 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  22.92 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  22.66 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  22.27 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  22.27 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  22.27 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  22.27 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  22.27 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  21.88 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  21.88 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  22.66 
 
 		 1101 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  27.44 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 		 1154 aa  67.4  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  27.33 
 
 		 948 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  21.65 
 
 		 1124 aa  63.9  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  28.68 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  21.39 
 
 		 426 aa  62  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  25.27 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.34 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  24.62 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  20.76 
 
 		 1118 aa  58.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  30.63 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  23.37 
 
 		 1120 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  28.76 
 
 		 373 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.86 
 
 		 478 aa  56.2  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  23.94 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  33.67 
 
 		 113 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  22.88 
 
 		 521 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  24.42 
 
 		 342 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 175 aa  53.9  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  22.89 
 
 		 867 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  25.64 
 
 		 298 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  23.24 
 
 		 869 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  28.48 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  21.48 
 
 		 868 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  26.36 
 
 		 216 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.96 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  21.48 
 
 		 868 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 1782 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  21.13 
 
 		 868 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  23.79 
 
 		 674 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  19.59 
 
 		 554 aa  51.2  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  25 
 
 		 214 aa  50.8  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  22.06 
 
 		 868 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  30.2 
 
 		 950 aa  50.8  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  23.79 
 
 		 674 aa  50.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 		 355 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  23.79 
 
 		 674 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  19.92 
 
 		 1132 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  22.06 
 
 		 868 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  24.2 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  28.18 
 
 		 784 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  24.42 
 
 		 674 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  30.91 
 
 		 292 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  22.7 
 
 		 863 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  25.43 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>