73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2862 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 329 aa  635    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  46 
 
 		 580 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.49 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  25.1 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  28.03 
 
 		 420 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  26.69 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  31.01 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  26.67 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  31.28 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  25.29 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.14 
 
 		 1115 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 356 aa  99.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  24.51 
 
 		 384 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  24.93 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.13 
 
 		 1115 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.93 
 
 		 1119 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  25.84 
 
 		 503 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  23.96 
 
 		 343 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  26.69 
 
 		 390 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  26.52 
 
 		 451 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.86 
 
 		 1115 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  23.79 
 
 		 426 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.61 
 
 		 1115 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.6 
 
 		 927 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 418 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 583 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  24.51 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  24.02 
 
 		 579 aa  83.2  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 793 aa  82.8  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  25.08 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  27.19 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  24.89 
 
 		 647 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  24.44 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  26.57 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  27.07 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  24.91 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  21.75 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  23.34 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  23.3 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  23.3 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  23.3 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  23.3 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  23.3 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  23.3 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  23.32 
 
 		 688 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  23.3 
 
 		 430 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  23.3 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  23.3 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  22.3 
 
 		 1118 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  23.66 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  20.8 
 
 		 1154 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  22.34 
 
 		 1124 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 		 1101 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.69 
 
 		 872 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 		 1782 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00509  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13720)  25.6 
 
 		 1481 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.658967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  26.29 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  19.53 
 
 		 521 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 652 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  26.53 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  26.58 
 
 		 541 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  26.8 
 
 		 808 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  28.4 
 
 		 792 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  29.81 
 
 		 499 aa  46.2  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  26.03 
 
 		 807 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  28.57 
 
 		 1271 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  24.37 
 
 		 822 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  23.24 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>