39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2820 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  72.68 
 
 
808 aa  1231    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  100 
 
 
822 aa  1706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  73.98 
 
 
807 aa  1267    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0423  glycosyl hydrolase-like protein  76.3 
 
 
135 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.11376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  28.5 
 
 
349 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  25.33 
 
 
426 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  24.08 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  28.63 
 
 
542 aa  66.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  23.85 
 
 
793 aa  65.1  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  25.48 
 
 
384 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 
427 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 
426 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  30.58 
 
 
415 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
307 aa  59.3  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  27.22 
 
 
390 aa  58.9  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  24.85 
 
 
451 aa  57.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  24.3 
 
 
374 aa  58.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  24.3 
 
 
430 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  24.3 
 
 
430 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.4 
 
 
433 aa  57.4  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  26.09 
 
 
426 aa  57  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  23.9 
 
 
430 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  23.9 
 
 
430 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  39.34 
 
 
430 aa  55.5  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  23.9 
 
 
430 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  23.9 
 
 
430 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  23.9 
 
 
430 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  23.9 
 
 
430 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  23.9 
 
 
430 aa  55.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  23.14 
 
 
430 aa  51.2  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  20.56 
 
 
420 aa  50.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  25.49 
 
 
688 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  22.27 
 
 
312 aa  49.3  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  24.51 
 
 
342 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  23.68 
 
 
356 aa  46.6  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  18.62 
 
 
1115 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 
329 aa  44.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  18.62 
 
 
1115 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>