45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1613 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  73.98 
 
 		 822 aa  1267    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  77.63 
 
 		 808 aa  1313    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  100 
 
 		 807 aa  1664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0423  glycosyl hydrolase-like protein  94.81 
 
 		 135 aa  263  6.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.11376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  27.35 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  25.62 
 
 		 316 aa  69.7  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  27.43 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  26.24 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  29.59 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  25.98 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 793 aa  64.7  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  25.74 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.47 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  26.78 
 
 		 542 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  25.2 
 
 		 430 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  25.2 
 
 		 430 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  25.1 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  25.1 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  25.1 
 
 		 430 aa  62  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  25.1 
 
 		 430 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  25.63 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  24.31 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  29.75 
 
 		 415 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  23.36 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  40.98 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 307 aa  56.6  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  22.13 
 
 		 420 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  24.53 
 
 		 312 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  26.17 
 
 		 688 aa  52  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  17.62 
 
 		 1115 aa  47.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  17.62 
 
 		 1115 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  28.26 
 
 		 356 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  21.85 
 
 		 428 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  32.63 
 
 		 428 aa  47  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  26.03 
 
 		 329 aa  45.8  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  28.4 
 
 		 343 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  22.47 
 
 		 503 aa  45.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  25.26 
 
 		 342 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  30.16 
 
 		 423 aa  44.3  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  16.86 
 
 		 1119 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>