More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0643 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 542 aa  1116    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  30.35 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  30.9 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  29.38 
 
 		 567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  29.39 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  28.9 
 
 		 384 aa  127  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  35.75 
 
 		 518 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  42.17 
 
 		 1194 aa  123  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  27.09 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  28.66 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  28.14 
 
 		 579 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  28.92 
 
 		 358 aa  120  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  42.2 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  38.01 
 
 		 758 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  38.76 
 
 		 820 aa  115  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  29.49 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  30.08 
 
 		 420 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  29.6 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  37.43 
 
 		 920 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  28.16 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  37.79 
 
 		 526 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  38.51 
 
 		 625 aa  110  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  27.79 
 
 		 444 aa  110  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 710 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  33.62 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  36.65 
 
 		 660 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 307 aa  107  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.15 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 		 312 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  34.97 
 
 		 218 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  36.57 
 
 		 693 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  30.2 
 
 		 1226 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  34.29 
 
 		 921 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.42 
 
 		 1115 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 		 356 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  38.92 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.81 
 
 		 1821 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  34.64 
 
 		 932 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.42 
 
 		 1115 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.94 
 
 		 447 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  34.81 
 
 		 1154 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  34.78 
 
 		 631 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  34.55 
 
 		 926 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  34.3 
 
 		 531 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  25.21 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 		 1029 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  26.71 
 
 		 428 aa  99.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  27.21 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.75 
 
 		 1115 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 1321 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  35.43 
 
 		 807 aa  97.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.75 
 
 		 3027 aa  97.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 223 aa  96.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  28.7 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.16 
 
 		 1054 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  33.7 
 
 		 1208 aa  96.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.08 
 
 		 1115 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  31.28 
 
 		 4630 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  33.92 
 
 		 914 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.07 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  33.52 
 
 		 1168 aa  94.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.67 
 
 		 1119 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 939 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  25.17 
 
 		 647 aa  93.6  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  31.03 
 
 		 530 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  37.09 
 
 		 688 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  33.69 
 
 		 629 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  35.12 
 
 		 288 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 		 793 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.18 
 
 		 1016 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  33.74 
 
 		 1081 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.62 
 
 		 6885 aa  90.9  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  34.92 
 
 		 767 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  28.1 
 
 		 688 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  32.8 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  33.89 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.24 
 
 		 1013 aa  87.8  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  32.98 
 
 		 685 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  32.76 
 
 		 863 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  33.91 
 
 		 822 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1260 aa  87  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.74 
 
 		 1847 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  24.01 
 
 		 343 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  35.43 
 
 		 861 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  31.76 
 
 		 530 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  36.57 
 
 		 859 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.92 
 
 		 2313 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  35.43 
 
 		 862 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 		 995 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 692 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  31.18 
 
 		 935 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  33.7 
 
 		 733 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  35.43 
 
 		 862 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  33.54 
 
 		 604 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  23.91 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  23.91 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  32.96 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>