More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3079 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  100 
 
 
688 aa  1394    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  46.23 
 
 
2313 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0736  cellulosome anchoring protein, cohesin region  42.34 
 
 
1305 aa  333  8e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.4308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  52.59 
 
 
447 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  44.71 
 
 
631 aa  183  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  43.41 
 
 
631 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  42.31 
 
 
857 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0735  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.82 
 
 
268 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000183583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  30.68 
 
 
1756 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  33.53 
 
 
223 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  32.3 
 
 
1710 aa  96.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  38.51 
 
 
758 aa  95.5  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  35.42 
 
 
625 aa  95.5  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  31.61 
 
 
1081 aa  95.1  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  28.04 
 
 
506 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  28.49 
 
 
1821 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.18 
 
 
4630 aa  94.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  31.65 
 
 
920 aa  94  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  28.43 
 
 
693 aa  93.6  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  33.53 
 
 
685 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  32.91 
 
 
531 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  38.79 
 
 
573 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  31.48 
 
 
1009 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  37.09 
 
 
542 aa  91.3  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 
693 aa  89.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  32.08 
 
 
935 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.05 
 
 
760 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  35.17 
 
 
457 aa  88.2  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  28.87 
 
 
1174 aa  87.4  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  33.97 
 
 
914 aa  87.4  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  30.97 
 
 
926 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  33.14 
 
 
939 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 
1321 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 
1328 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.25 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  32.32 
 
 
710 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  34.33 
 
 
1260 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30.77 
 
 
760 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  37.31 
 
 
820 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  31.46 
 
 
1226 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  37.29 
 
 
552 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  32.41 
 
 
1184 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.06 
 
 
1847 aa  81.3  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  30.68 
 
 
530 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  36.97 
 
 
692 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  35.04 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  36.42 
 
 
1208 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  34.62 
 
 
604 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  32.59 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  30.77 
 
 
518 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  35.29 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  30.91 
 
 
767 aa  78.6  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  30.43 
 
 
765 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3079  S-layer domain-containing protein  30.77 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00407432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  30 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  29.45 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000983689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  30.43 
 
 
542 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  29.45 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  29.45 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  30.43 
 
 
779 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  31.65 
 
 
807 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  30.18 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  30.43 
 
 
772 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  30.72 
 
 
530 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  29.93 
 
 
766 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  31.65 
 
 
921 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  29.03 
 
 
932 aa  77.4  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  29.93 
 
 
755 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  30.26 
 
 
526 aa  77  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  29.93 
 
 
766 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  35.4 
 
 
546 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  31.89 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  32.21 
 
 
1168 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.85 
 
 
1029 aa  76.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3093  S-layer protein  29.66 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000122253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  30.25 
 
 
880 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 
1231 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  32 
 
 
548 aa  75.1  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  37.14 
 
 
1194 aa  75.1  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2990  S-layer protein  29.66 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3338  S-layer protein  29.66 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3315  putative S-layer protein  29.66 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  34.21 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  26.64 
 
 
660 aa  74.3  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  34.21 
 
 
822 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  31.58 
 
 
410 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 
410 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 
410 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 
410 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  36.45 
 
 
669 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 
410 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  26.52 
 
 
413 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.65 
 
 
3027 aa  73.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.05 
 
 
640 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  26.83 
 
 
935 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  38.18 
 
 
288 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.77 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  43.16 
 
 
754 aa  71.6  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  31.9 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  36.28 
 
 
657 aa  71.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>