More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2998 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
926 aa  1870    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  53.23 
 
 
1226 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  48.68 
 
 
920 aa  363  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  47.14 
 
 
531 aa  334  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  42.01 
 
 
288 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  47.71 
 
 
1081 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  45.66 
 
 
223 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 
1321 aa  159  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  44.06 
 
 
573 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  39.38 
 
 
1710 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  41.4 
 
 
756 aa  136  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  42.77 
 
 
693 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  41.04 
 
 
518 aa  135  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  40.83 
 
 
1821 aa  135  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  39.78 
 
 
506 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  38.8 
 
 
1009 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  37.64 
 
 
625 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  41.18 
 
 
526 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  39.02 
 
 
1194 aa  126  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  36.93 
 
 
710 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  33.51 
 
 
548 aa  124  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  41.08 
 
 
767 aa  124  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  35.78 
 
 
758 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  38.37 
 
 
921 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 
1328 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  39.15 
 
 
685 aa  119  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  40.56 
 
 
548 aa  118  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  33.96 
 
 
1260 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  37.36 
 
 
1208 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  33.7 
 
 
693 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  30.58 
 
 
1421 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  36.31 
 
 
1013 aa  116  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  37.08 
 
 
506 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.58 
 
 
4630 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  34.86 
 
 
820 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  37.72 
 
 
932 aa  115  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.52 
 
 
1661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  37.06 
 
 
1223 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.71 
 
 
995 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  37.65 
 
 
457 aa  111  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  34.12 
 
 
218 aa  111  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.09 
 
 
1234 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  32.85 
 
 
935 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  37.3 
 
 
629 aa  110  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  31.03 
 
 
413 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  32.2 
 
 
431 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  34.59 
 
 
660 aa  107  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  38.07 
 
 
1168 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  34.08 
 
 
546 aa  106  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  35.38 
 
 
805 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  33.53 
 
 
1174 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.91 
 
 
1016 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  32.42 
 
 
554 aa  104  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  34.27 
 
 
748 aa  103  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 
1029 aa  104  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  29.72 
 
 
413 aa  103  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  35.75 
 
 
524 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.85 
 
 
558 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  34.88 
 
 
618 aa  102  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.44 
 
 
640 aa  102  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  32.6 
 
 
733 aa  102  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  35.14 
 
 
754 aa  101  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  30.77 
 
 
657 aa  101  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  32.97 
 
 
1847 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.77 
 
 
447 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  34.55 
 
 
542 aa  100  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  31.86 
 
 
692 aa  100  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  30.89 
 
 
1042 aa  98.6  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  31.89 
 
 
552 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34.2 
 
 
3027 aa  97.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.35 
 
 
1054 aa  97.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  33.52 
 
 
547 aa  96.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28.37 
 
 
1495 aa  96.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  30.37 
 
 
414 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  33.55 
 
 
631 aa  95.9  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  29.21 
 
 
461 aa  94.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.53 
 
 
6885 aa  94.4  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  31.55 
 
 
834 aa  94.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  32.37 
 
 
624 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.48 
 
 
2313 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  33.55 
 
 
669 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  32.02 
 
 
935 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  32.81 
 
 
620 aa  92  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  28.52 
 
 
585 aa  91.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.06 
 
 
461 aa  92  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  29.06 
 
 
461 aa  90.9  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  29.05 
 
 
880 aa  90.9  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  29.06 
 
 
461 aa  90.9  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.06 
 
 
461 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  32.29 
 
 
620 aa  90.5  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  32.2 
 
 
615 aa  89.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  32.21 
 
 
375 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  31.77 
 
 
620 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.35 
 
 
631 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  29.07 
 
 
822 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  31.61 
 
 
2207 aa  89.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.58 
 
 
1231 aa  88.6  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.73 
 
 
843 aa  88.2  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  26.42 
 
 
1154 aa  88.2  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  32.24 
 
 
857 aa  87.8  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>