More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3093 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
935 aa  1892    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  43.66 
 
 
1184 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  37.94 
 
 
1756 aa  308  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  45.63 
 
 
693 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  32.97 
 
 
1226 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.54 
 
 
447 aa  94  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  38.35 
 
 
413 aa  93.2  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  44.9 
 
 
920 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  33.54 
 
 
286 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  43.88 
 
 
926 aa  92.8  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 
471 aa  92  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  35.29 
 
 
552 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.68 
 
 
688 aa  91.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  37.65 
 
 
431 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  32.93 
 
 
914 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  36.54 
 
 
413 aa  90.9  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  33.54 
 
 
939 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 
631 aa  89.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  33.87 
 
 
932 aa  89.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.61 
 
 
1328 aa  89.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  33.7 
 
 
1009 aa  89  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.9 
 
 
640 aa  89  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  31.47 
 
 
669 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  44.68 
 
 
2313 aa  88.2  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  33.72 
 
 
282 aa  87.8  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  32.42 
 
 
218 aa  87  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  42.57 
 
 
414 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  29.69 
 
 
396 aa  86.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  37.42 
 
 
1174 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34.3 
 
 
693 aa  85.5  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  46.24 
 
 
624 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  31.03 
 
 
4630 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  39.13 
 
 
573 aa  83.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  39.81 
 
 
546 aa  82.8  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  30 
 
 
857 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.9 
 
 
558 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  37.61 
 
 
1821 aa  81.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  34.52 
 
 
333 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  42.7 
 
 
1168 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  37.12 
 
 
457 aa  79  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.9 
 
 
1234 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 
542 aa  79  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  35.05 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.37 
 
 
1029 aa  78.2  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  31.11 
 
 
867 aa  78.2  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0748  hypothetical protein  45.71 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  31.31 
 
 
594 aa  77.8  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34.45 
 
 
3027 aa  77.8  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  39.34 
 
 
1042 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  34.73 
 
 
548 aa  77.4  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  30.64 
 
 
692 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  33.97 
 
 
1847 aa  76.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  41.53 
 
 
1208 aa  76.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  30.14 
 
 
758 aa  77  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  37.23 
 
 
807 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  31.35 
 
 
921 aa  77  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.6 
 
 
995 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  30.2 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  34.02 
 
 
629 aa  75.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  35.78 
 
 
506 aa  75.5  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4531  S-layer region-like  30.63 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  31.71 
 
 
760 aa  75.5  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  32.12 
 
 
625 aa  75.1  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  45.92 
 
 
767 aa  74.7  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  31.1 
 
 
760 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  35.66 
 
 
410 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  30.6 
 
 
223 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  31.21 
 
 
710 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  32.08 
 
 
526 aa  74.3  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  39.13 
 
 
531 aa  73.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  29.78 
 
 
717 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  35.2 
 
 
1194 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3133  S-layer domain protein  30.86 
 
 
604 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.181258  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  31.16 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  35.05 
 
 
754 aa  72.4  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1054  S-layer-like region  28.57 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  30.05 
 
 
461 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1556  S-layer domain-containing protein  27.4 
 
 
536 aa  71.6  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013554 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  30.23 
 
 
538 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  30.9 
 
 
755 aa  71.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  33.1 
 
 
1013 aa  71.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1252  putative S-layer protein  30.63 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.678676  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  34.74 
 
 
1260 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  41.76 
 
 
1081 aa  71.2  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  33.33 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  27.96 
 
 
575 aa  70.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  29.44 
 
 
461 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  29.44 
 
 
461 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1205  putative S-layer protein  38.95 
 
 
223 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.567806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1048  S-layer protein  38.95 
 
 
223 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000983689  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  29.58 
 
 
461 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  29.74 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  32.08 
 
 
772 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1010  NEAr transporter  29.56 
 
 
343 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  36.89 
 
 
1223 aa  70.1  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1127  S-layer protein  38.95 
 
 
223 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.600339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  26.07 
 
 
1710 aa  70.1  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.81 
 
 
1016 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  30.54 
 
 
520 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>