More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2498 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  100 
 
 
867 aa  1788    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.1 
 
 
665 aa  158  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.28 
 
 
924 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.82 
 
 
907 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.23 
 
 
705 aa  156  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.31 
 
 
656 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.27 
 
 
662 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.27 
 
 
662 aa  154  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.27 
 
 
662 aa  154  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.03 
 
 
654 aa  154  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2507  putative peptidase  94.74 
 
 
80 aa  153  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.05 
 
 
632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.14 
 
 
662 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  27.65 
 
 
649 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.23 
 
 
646 aa  144  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.95 
 
 
661 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.54 
 
 
654 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  26.89 
 
 
640 aa  141  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.03 
 
 
662 aa  141  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.03 
 
 
661 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
654 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  27.21 
 
 
655 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.2 
 
 
649 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.12 
 
 
626 aa  138  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 
629 aa  138  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  30.36 
 
 
662 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.52 
 
 
659 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.12 
 
 
623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.68 
 
 
629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.41 
 
 
657 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.87 
 
 
653 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 
656 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.09 
 
 
626 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  30.9 
 
 
653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.58 
 
 
655 aa  131  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.91 
 
 
630 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.8 
 
 
631 aa  131  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  26 
 
 
634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  26.77 
 
 
642 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  26.26 
 
 
681 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.75 
 
 
642 aa  126  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.4 
 
 
641 aa  124  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.83 
 
 
706 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  24.71 
 
 
645 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  25.27 
 
 
694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.1 
 
 
682 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  28.16 
 
 
759 aa  120  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
665 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.93 
 
 
650 aa  118  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  37.5 
 
 
1184 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.47 
 
 
645 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  27.69 
 
 
665 aa  115  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.01 
 
 
644 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.56 
 
 
645 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 
645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 
645 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.8 
 
 
646 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.76 
 
 
688 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.11 
 
 
755 aa  111  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.95 
 
 
686 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.38 
 
 
666 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.2 
 
 
644 aa  109  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.76 
 
 
652 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.82 
 
 
685 aa  108  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.5 
 
 
626 aa  108  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  28.89 
 
 
636 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.26 
 
 
626 aa  106  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.63 
 
 
636 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.76 
 
 
645 aa  105  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.26 
 
 
626 aa  104  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.06 
 
 
642 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.74 
 
 
638 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.55 
 
 
650 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.17 
 
 
686 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  26.97 
 
 
648 aa  101  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.86 
 
 
632 aa  100  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.74 
 
 
632 aa  100  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.5 
 
 
621 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.84 
 
 
649 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.67 
 
 
594 aa  99  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.84 
 
 
629 aa  97.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.63 
 
 
588 aa  97.4  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.11 
 
 
615 aa  96.3  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.62 
 
 
665 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.91 
 
 
656 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.08 
 
 
731 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0732  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.23 
 
 
626 aa  95.5  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.517111 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.66 
 
 
622 aa  95.1  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1119  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.62 
 
 
688 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.734549  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.63 
 
 
688 aa  94.7  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25820  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  26.02 
 
 
648 aa  94.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6776  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.71 
 
 
661 aa  94.4  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.84 
 
 
638 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0773  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.32 
 
 
571 aa  94  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.35 
 
 
634 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.29 
 
 
572 aa  92.4  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.393632 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.01 
 
 
662 aa  92  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0933  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.78 
 
 
668 aa  91.3  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.115287  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1149  Acylaminoacyl-peptidase  26.48 
 
 
618 aa  91.3  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0889139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3158  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.46 
 
 
668 aa  90.9  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>