More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4565 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  73.21 
 
 
654 aa  1026    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.62 
 
 
654 aa  993    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  62.69 
 
 
662 aa  882    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.08 
 
 
662 aa  871    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  62.54 
 
 
662 aa  879    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  61.47 
 
 
653 aa  853    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.54 
 
 
662 aa  878    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  63.15 
 
 
661 aa  866    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.39 
 
 
662 aa  857    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  70.67 
 
 
654 aa  999    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  64.38 
 
 
659 aa  906    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.84 
 
 
649 aa  685    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
657 aa  1355    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.69 
 
 
661 aa  878    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  50.53 
 
 
653 aa  687    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  62.84 
 
 
649 aa  868    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  62.54 
 
 
662 aa  878    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  40.99 
 
 
642 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  39.62 
 
 
648 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.42 
 
 
623 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.12 
 
 
650 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.22 
 
 
646 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  31.76 
 
 
655 aa  301  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  31.07 
 
 
640 aa  294  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.2 
 
 
656 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.98 
 
 
665 aa  280  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  29.94 
 
 
759 aa  266  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  28.61 
 
 
646 aa  266  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.71 
 
 
632 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.24 
 
 
666 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.2 
 
 
705 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.69 
 
 
644 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.07 
 
 
655 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.94 
 
 
924 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  28.62 
 
 
645 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.27 
 
 
665 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.06 
 
 
907 aa  243  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.17 
 
 
630 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.96 
 
 
645 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.32 
 
 
644 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.85 
 
 
645 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.04 
 
 
656 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.07 
 
 
645 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.17 
 
 
634 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.37 
 
 
665 aa  227  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 
645 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.18 
 
 
645 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.62 
 
 
632 aa  220  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.56 
 
 
642 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  27.24 
 
 
694 aa  217  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.06 
 
 
631 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.7 
 
 
642 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  27.34 
 
 
665 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.91 
 
 
626 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
755 aa  211  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.73 
 
 
706 aa  210  8e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
626 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.57 
 
 
629 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.56 
 
 
652 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.61 
 
 
629 aa  207  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2025  prolyl oligopeptidase family protein  26.53 
 
 
636 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00251963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  31.99 
 
 
634 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0494  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 
685 aa  203  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0656758  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.11 
 
 
662 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179177  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.42 
 
 
688 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.34 
 
 
682 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.54 
 
 
641 aa  188  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.77 
 
 
731 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.32 
 
 
636 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.04 
 
 
688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.83 
 
 
632 aa  179  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.38 
 
 
626 aa  178  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.2 
 
 
626 aa  176  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.2 
 
 
626 aa  176  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.9 
 
 
686 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0495  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.11 
 
 
692 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.468891  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.73 
 
 
650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.71 
 
 
686 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  29.39 
 
 
681 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0061  prolyl oligopeptidase family protein  29.18 
 
 
653 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101557  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.1 
 
 
629 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  29.19 
 
 
615 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.79 
 
 
678 aa  144  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2873  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.9 
 
 
677 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.7 
 
 
612 aa  140  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.67 
 
 
652 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.01 
 
 
617 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.51 
 
 
594 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.04 
 
 
683 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  29.41 
 
 
867 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0382  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.42 
 
 
569 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0110228  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.5 
 
 
596 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.09 
 
 
611 aa  130  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.88 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1310  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.68 
 
 
588 aa  128  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0407114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.05 
 
 
656 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.01 
 
 
655 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.77 
 
 
644 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.07 
 
 
668 aa  124  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0240  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26 
 
 
572 aa  124  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.393632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>