More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4772 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  54.44 
 
 
626 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
632 aa  1286    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  53.72 
 
 
626 aa  648    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  54.13 
 
 
626 aa  648    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  51.58 
 
 
636 aa  625  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  52.91 
 
 
641 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  47.76 
 
 
694 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1803  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.51 
 
 
731 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.67 
 
 
630 aa  458  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  40.42 
 
 
646 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.82 
 
 
706 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2049  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.02 
 
 
907 aa  412  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.564098  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17781  hypothetical protein  38.34 
 
 
681 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.46714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1646  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.24 
 
 
705 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.106603  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.46 
 
 
924 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.5 
 
 
626 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.34 
 
 
631 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.04 
 
 
626 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  38.34 
 
 
634 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.72 
 
 
632 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.34 
 
 
629 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.22 
 
 
644 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  34.2 
 
 
655 aa  339  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  33.06 
 
 
640 aa  336  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.7 
 
 
650 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.85 
 
 
629 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.68 
 
 
655 aa  316  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.87 
 
 
642 aa  313  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  31.91 
 
 
759 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.61 
 
 
656 aa  290  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.2 
 
 
688 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.47 
 
 
682 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0482  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.37 
 
 
686 aa  278  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.28 
 
 
666 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.017012  decreased coverage  0.000228688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3884  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.4 
 
 
686 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.913505  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0365  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.32 
 
 
632 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.49 
 
 
638 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.03 
 
 
610 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  29.36 
 
 
657 aa  226  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  27.79 
 
 
678 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.94 
 
 
652 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.55 
 
 
615 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.89 
 
 
653 aa  210  6e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0702  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  41.64 
 
 
665 aa  210  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.36 
 
 
659 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  25.27 
 
 
649 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.44 
 
 
600 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.61 
 
 
656 aa  197  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4496  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.45 
 
 
657 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.597999  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.25 
 
 
612 aa  194  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  27.9 
 
 
648 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.42 
 
 
623 aa  193  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  28.76 
 
 
638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0312  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.54 
 
 
588 aa  191  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.75 
 
 
654 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0322  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.63 
 
 
653 aa  190  9e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0395751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0194  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.76 
 
 
638 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.08 
 
 
597 aa  188  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.46 
 
 
611 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1087  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.55 
 
 
650 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393964  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0078  prolyl oligopeptidase family protein  28.99 
 
 
665 aa  183  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.41 
 
 
665 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  26.91 
 
 
642 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.24 
 
 
629 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3234  acylamino-acid-releasing enzyme  26.18 
 
 
596 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4565  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.83 
 
 
657 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00542478  unclonable  0.0000000539912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0844  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.26 
 
 
646 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3833  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.8 
 
 
649 aa  177  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.73 
 
 
654 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0003  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.01 
 
 
665 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.7 
 
 
662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.21 
 
 
662 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.21 
 
 
662 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.12 
 
 
652 aa  170  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.06 
 
 
621 aa  169  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4323  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.22 
 
 
645 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4124  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.22 
 
 
645 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.96 
 
 
662 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.36 
 
 
654 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.01 
 
 
661 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4252  prolyl oligopeptidase family protein  27.76 
 
 
662 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  27.57 
 
 
653 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.89 
 
 
645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3063  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.16 
 
 
688 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.79 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4618  prolyl oligopeptidase family protein  31.33 
 
 
645 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.68 
 
 
634 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3601  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.52 
 
 
661 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 
607 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3803  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.33 
 
 
645 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.6032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.38 
 
 
605 aa  163  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.27 
 
 
662 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.824077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1195  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.98 
 
 
645 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.430413  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3064  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.48 
 
 
755 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.43 
 
 
642 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.84 
 
 
644 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.99 
 
 
594 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.03 
 
 
628 aa  159  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0843  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.97 
 
 
653 aa  157  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.22 
 
 
695 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>